Package: garli-mpi (2.1-9)

[ Source: garli  ]

analisi filogenetica di dati di sequenze molecolari usando la massima verosimiglianza (MPI)

GARLI, Genetic Algorithm for Rapid Likelihood Inference, è un programma per inferire alberi filogenetici. Usando un approccio simile a un algoritmo genetico classico, cerca rapidamente nello spazio degli alberi evoluzionistici e dei parametri dei modelli per trovare la soluzione che massimizza il punteggio di verosimiglianza. Implementa modelli di evoluzione di sequenze basati su codoni, amminoacidi e nucleotidi e funziona su tutte le piattaforme. L'ultima versione aggiunge la gestione di modelli partizionati e tipi di dati tipo morfologia.

Questa versione di Garli usa MPI.

Other Packages Related to garli-mpi

• dep: libc6 (>= 2.38) [not arm64]

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [arm64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [not armel, armhf, riscv64]

  libreria di supporto a GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [riscv64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libmpich12 [armel, armhf, i386]

  Shared libraries for MPICH

• dep: libncl2 (>= 2.1.18) [amd64]

  NEXUS Class Library

  dep: libncl2 (>= 2.1.21+git20210811.b1213a7) [not amd64]

• dep: libopenmpi40 (>= 5.0.6) [not armel, armhf, i386]

  libreria per il passaggio di messaggi dalle alte prestazioni - libreria condivisa

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  libreria GNU Standard C++, versione 3

• dep: mpi-default-bin

  programmi MPI runtime standard (metapacchetto)

Download garli-mpi

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	622.2 kB	1,656.0 kB	[list of files]
arm64	560.1 kB	1,428.0 kB	[list of files]
armel	537.3 kB	1,427.0 kB	[list of files]
armhf	505.2 kB	979.0 kB	[list of files]
i386	556.0 kB	1,571.0 kB	[list of files]
mips64el	609.3 kB	1,838.0 kB	[list of files]
ppc64el	687.3 kB	1,748.0 kB	[list of files]
riscv64	657.0 kB	1,272.0 kB	[list of files]
s390x	509.1 kB	1,572.0 kB	[list of files]