Пакунок: tombo (1.5.1-6 and others)

[ Source: tombo  ]

identification of modified nucleotides from raw nanopore sequencing data

Tombo is a suite of tools primarily for the identification of modified nucleotides from nanopore sequencing data. Tombo also provides tools for the analysis and visualization of raw nanopore signal.

Інші пакунки пов'язані з tombo

• dep: cython3 [ia64]

  C-Extensions for Python 3

• dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.29) [not alpha, ia64, riscv64, sh4]

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.29) [alpha]

  Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
  also a virtual package provided by libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.36) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.3.4) [sh4]

  Допоміжна бібліотека GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  Допоміжна бібліотека GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  Допоміжна бібліотека GCC

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

  dep: python3 (<< 3.12) [ia64]

  dep: python3 (<< 3.13) [not ia64]

  dep: python3 (>= 3.11~) [ia64]

  dep: python3 (>= 3.12~) [not ia64]

• dep: python3-h5py

  general-purpose Python interface to hdf5

• dep: python3-mappy

  Python3 interface minimap2

• dep: python3-numpy [ia64]

  Fast array facility to the Python language (Python 3)

  dep: python3-numpy (>= 1:1.25.0) [not ia64]

• dep: python3-numpy-abi9 [not ia64]

  virtual package provided by python3-numpy

• dep: python3-pkg-resources

  Виявлення пакунків та доступ до ресурсів використовуючи pkg_resources

• dep: python3-scipy

  scientific tools for Python 3

• dep: python3-tqdm

  fast, extensible progress bar for Python 3 and CLI tool

• rec: python3-pyfaidx

  efficient random access to fasta subsequences for Python 3

• rec: python3-rpy2

  Python3 interface to the GNU R language and environment (version 2)

Завантажити tombo

Завантаження для всіх доступних архітектур

Архітектура	Версія	Розмір пакунка	Розмір після встановлення	Файли
alpha (unofficial port)	1.5.1-6+b1	424.9 kB	1,549.0 kB	[список файлів]
amd64	1.5.1-6+b1	431.1 kB	1,471.0 kB	[список файлів]
arm64	1.5.1-6+b1	419.9 kB	1,482.0 kB	[список файлів]
armel	1.5.1-6+b1	424.3 kB	1,435.0 kB	[список файлів]
armhf	1.5.1-6+b1	425.7 kB	1,359.0 kB	[список файлів]
hppa (unofficial port)	1.5.1-6+b1	436.4 kB	1,477.0 kB	[список файлів]
i386	1.5.1-6+b1	439.4 kB	1,499.0 kB	[список файлів]
ia64 (unofficial port)	1.5.1-4	432.8 kB	1,618.0 kB	[список файлів]
m68k (unofficial port)	1.5.1-6+b1	424.6 kB	1,439.0 kB	[список файлів]
mips64el	1.5.1-6+b1	419.9 kB	1,554.0 kB	[список файлів]
ppc64 (unofficial port)	1.5.1-6+b1	430.6 kB	1,547.0 kB	[список файлів]
ppc64el	1.5.1-6+b1	432.2 kB	1,546.0 kB	[список файлів]
riscv64	1.5.1-6+b2	432.3 kB	1,394.0 kB	[список файлів]
s390x	1.5.1-6+b1	434.8 kB	1,486.0 kB	[список файлів]
sh4 (unofficial port)	1.5.1-6+b1	461.0 kB	1,480.0 kB	[список файлів]
sparc64 (unofficial port)	1.5.1-6+b1	414.4 kB	3,217.0 kB	[список файлів]
x32 (unofficial port)	1.5.1-6	443.2 kB	1,470.0 kB	[список файлів]