Paquet : nast-ier (20101212+dfsg1-4)

[ Paquet source : microbiomeutil  ]

NAST-based DNA alignment tool

The NAST-iEr alignment utility aligns a single raw nucleotide sequence against one or more NAST formatted sequences.

The alignment algorithm involves global dynamic programming profile alignment to fixed (NAST-formatted) multiply aligned template sequences without any end-gap penalty.

NAST-iEr is part of the microbiomeutil suite.

Autres paquets associés à nast-ier

• dep: cdbfasta

  indexation avec Constant DataBase et outils de recherche pour les fichiers multi-FASTA

• dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.4) [non arm64, ppc64el]

• dep: microbiomeutil-data

  Reference 16S sequences and NAST-alignments used by microbiomeutil tools

• rec: ncbi-blast+

  suite d'outils de recherche de séquences BLAST de dernière génération

Télécharger nast-ier

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	20,7 ko	100,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	20,5 ko	95,0 ko	[liste des fichiers]
armel	20,0 ko	95,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	19,9 ko	91,0 ko	[liste des fichiers]
i386	21,0 ko	99,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	21,3 ko	101,0 ko	[liste des fichiers]
mipsel	21,0 ko	96,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	21,4 ko	148,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	20,7 ko	95,0 ko	[liste des fichiers]