Paquet : libbwa-dev (0.7.17-7 et autres)
Liens pour libbwa-dev
Ressources Debian :
- Rapports de bogues
- Developer Information
- Journal des modifications Debian
- Fichier de licence
- Suivis des correctifs pour Debian
Télécharger le paquet source bwa :
Responsables :
- Debian Med Packaging Team (Page QA, Archive du courrier électronique)
- Charles Plessy (Page QA)
- Andreas Tille (Page QA)
- Carlos Borroto (Page QA)
- Ognyan Kulev (Page QA)
- Michael R. Crusoe (Page QA)
Ressources externes :
- Page d'accueil [bio-bwa.sourceforge.net]
Paquets similaires :
fichiers source du dispositif d'alignement Burrows-Wheeler
BWA est un paquet logiciel pour mettre en correspondance des séquences à faible divergence avec un grand génome de référence tel que le génome humain. Il est constitué de trois algorithmes : BWA-backtrack, BWA-SW et BWA-MEM. Le premier algorithme est conçu pour les lectures de séquences Illumina jusqu'à 100 paires de bases, alors que les deux autres sont conçus pour des lectures de séquences allant de 70 à 1 000 paires de bases. BWA-MEM et BWA-SW partagent des fonctionnalités communes telles que la prise en charge des lectures longues et des alignements de découpages (« split alignment »), mais BWA-MEM, plus récent, est généralement recommandé pour les requêtes de haute qualité, car il est plus rapide et plus précis. BWA-MEM a également de meilleures performances que BWA-backtrack pour les lectures Illumina de 70 à 100 paires de bases.
Ce paquet fournit les fichiers source à utiliser dans d'autres programmes.
Autres paquets associés à libbwa-dev
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- sug: samtools
- traitement d'alignements de séquence pour les formats SAM et BAM et CRAM
Télécharger libbwa-dev
Architecture | Version | Taille du paquet | Espace occupé une fois installé | Fichiers |
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alpha (portage non officiel) | 0.7.17-7+b6 | 162,7 ko | 609,0 ko | [liste des fichiers] |
amd64 | 0.7.17-7+b4 | 150,4 ko | 469,0 ko | [liste des fichiers] |
arm64 | 0.7.17-7+b4 | 145,8 ko | 463,0 ko | [liste des fichiers] |
armel | 0.7.17-7+b4 | 144,1 ko | 422,0 ko | [liste des fichiers] |
armhf | 0.7.17-7+b4 | 144,7 ko | 355,0 ko | [liste des fichiers] |
hppa (portage non officiel) | 0.7.17-7+b4 | 167,3 ko | 476,0 ko | [liste des fichiers] |
i386 | 0.7.17-7+b4 | 166,8 ko | 476,0 ko | [liste des fichiers] |
ia64 (portage non officiel) | 0.7.17-7+b4 | 204,9 ko | 764,0 ko | [liste des fichiers] |
m68k (portage non officiel) | 0.7.17-7+b4 | 147,5 ko | 439,0 ko | [liste des fichiers] |
mips64el | 0.7.17-7+b4 | 157,7 ko | 552,0 ko | [liste des fichiers] |
ppc64 (portage non officiel) | 0.7.17-7+b4 | 161,7 ko | 540,0 ko | [liste des fichiers] |
ppc64el | 0.7.17-7+b4 | 167,5 ko | 547,0 ko | [liste des fichiers] |
riscv64 | 0.7.17-7+b4 | 292,9 ko | 2 224,0 ko | [liste des fichiers] |
s390x | 0.7.17-7+b4 | 161,5 ko | 506,0 ko | [liste des fichiers] |
sh4 (portage non officiel) | 0.7.17-7+b4 | 197,6 ko | 428,0 ko | [liste des fichiers] |
sparc64 (portage non officiel) | 0.7.17-7+b4 | 137,5 ko | 468,0 ko | [liste des fichiers] |
x32 (portage non officiel) | 0.7.17-7+b4 | 153,9 ko | 438,0 ko | [liste des fichiers] |