Paketti: libbwa-dev (0.7.17-7 ja muut)

[ Source: bwa  ]

Burrows-Wheeler Aligner source files

BWA is a software package for mapping low-divergent sequences against a large reference genome, such as the human genome. It consists of three algorithms: BWA-backtrack, BWA-SW and BWA-MEM. The first algorithm is designed for Illumina sequence reads up to 100bp, while the rest two for longer sequences ranged from 70bp to 1Mbp. BWA-MEM and BWA-SW share similar features such as long-read support and split alignment, but BWA-MEM, which is the latest, is generally recommended for high-quality queries as it is faster and more accurate. BWA-MEM also has better performance than BWA-backtrack for 70-100bp Illumina reads.

This package contains the source files for use in other programs.

Tagit: Software Development: Kirjastot, Field: Biology, field::biology:bioinformatics, implemented-in::c, User Interface: Command Line, Role: role::devel-lib, role::program, Source Code, Purpose: use::comparing, works-with::biological-sequence

Muut pakettiin libbwa-dev liittyvät paketit

• sug: samtools

  processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

Imuroi libbwa-dev

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Versio	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
alpha (epävirallinen siirros)	0.7.17-7+b6	162.7 kt	609.0 kt	[tiedostoluettelo]
amd64	0.7.17-7+b4	150.4 kt	469.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	0.7.17-7+b4	145.8 kt	463.0 kt	[tiedostoluettelo]
armel	0.7.17-7+b4	144.1 kt	422.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	0.7.17-7+b4	144.7 kt	355.0 kt	[tiedostoluettelo]
hppa (epävirallinen siirros)	0.7.17-7+b4	167.3 kt	476.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	0.7.17-7+b4	166.8 kt	476.0 kt	[tiedostoluettelo]
ia64 (epävirallinen siirros)	0.7.17-7+b4	204.9 kt	764.0 kt	[tiedostoluettelo]
m68k (epävirallinen siirros)	0.7.17-7+b4	147.5 kt	439.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	0.7.17-7+b4	157.7 kt	552.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64 (epävirallinen siirros)	0.7.17-7+b4	161.7 kt	540.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	0.7.17-7+b4	167.5 kt	547.0 kt	[tiedostoluettelo]
riscv64	0.7.17-7+b4	292.9 kt	2,224.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	0.7.17-7+b4	161.5 kt	506.0 kt	[tiedostoluettelo]
sh4 (epävirallinen siirros)	0.7.17-7+b4	197.6 kt	428.0 kt	[tiedostoluettelo]
sparc64 (epävirallinen siirros)	0.7.17-7+b4	137.5 kt	468.0 kt	[tiedostoluettelo]
x32 (epävirallinen siirros)	0.7.17-7+b4	153.9 kt	438.0 kt	[tiedostoluettelo]