Pakiet: libbwa-dev (0.7.18-1 i inne)

[ Pakiet źródłowy: bwa  ]

Burrows-Wheeler Aligner source files

BWA is a software package for mapping low-divergent sequences against a large reference genome, such as the human genome. It consists of three algorithms: BWA-backtrack, BWA-SW and BWA-MEM. The first algorithm is designed for Illumina sequence reads up to 100bp, while the rest two for longer sequences ranged from 70bp to 1Mbp. BWA-MEM and BWA-SW share similar features such as long-read support and split alignment, but BWA-MEM, which is the latest, is generally recommended for high-quality queries as it is faster and more accurate. BWA-MEM also has better performance than BWA-backtrack for 70-100bp Illumina reads.

This package contains the source files for use in other programs.

Znaczniki: Rozwój oprogramowania: Biblioteki, Dziedzina: Biologia, field::biology:bioinformatics, implemented-in::c, Interfejs użytkownika: Wiersz poleceń, Rola: role::devel-lib, role::program, Kod źródłowy, Przeznaczenie: use::comparing, works-with::biological-sequence

Inne pakiety związane z libbwa-dev

• sug: samtools

  Przetwarzanie dopasowań sekwencji w formatach SAM, BAM i CRAM

Pobieranie libbwa-dev

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	0.7.18-1	167,9 KiB	626,0 KiB	[lista plików]
amd64	0.7.18-1	152,0 KiB	479,0 KiB	[lista plików]
arm64	0.7.18-1	147,0 KiB	472,0 KiB	[lista plików]
armel	0.7.18-1	147,3 KiB	435,0 KiB	[lista plików]
armhf	0.7.18-1	147,3 KiB	365,0 KiB	[lista plików]
hppa (port nieoficjalny)	0.7.18-1	169,7 KiB	484,0 KiB	[lista plików]
i386	0.7.18-1	168,4 KiB	482,0 KiB	[lista plików]
ia64 (port nieoficjalny)	0.7.17-7+b4	204,9 KiB	764,0 KiB	[lista plików]
m68k (port nieoficjalny)	0.7.18-1	149,0 KiB	446,0 KiB	[lista plików]
mips64el	0.7.18-1	160,8 KiB	568,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	0.7.18-1	165,0 KiB	554,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	0.7.18-1	173,8 KiB	567,0 KiB	[lista plików]
riscv64	0.7.18-1	300,8 KiB	2 340,0 KiB	[lista plików]
s390x	0.7.18-1	165,3 KiB	519,0 KiB	[lista plików]
sh4 (port nieoficjalny)	0.7.18-1	200,6 KiB	439,0 KiB	[lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny)	0.7.18-1	140,9 KiB	482,0 KiB	[lista plików]
x32 (port nieoficjalny)	0.7.18-1	155,4 KiB	447,0 KiB	[lista plików]