パッケージ: libbwa-dev (0.7.18-1 など)

[ ソース: bwa  ]

Burrows-Wheeler Aligner source files

BWA is a software package for mapping low-divergent sequences against a large reference genome, such as the human genome. It consists of three algorithms: BWA-backtrack, BWA-SW and BWA-MEM. The first algorithm is designed for Illumina sequence reads up to 100bp, while the rest two for longer sequences ranged from 70bp to 1Mbp. BWA-MEM and BWA-SW share similar features such as long-read support and split alignment, but BWA-MEM, which is the latest, is generally recommended for high-quality queries as it is faster and more accurate. BWA-MEM also has better performance than BWA-backtrack for 70-100bp Illumina reads.

This package contains the source files for use in other programs.

タグ: ソフトウェア開発: ライブラリ, 分野: 生物学, field::biology:bioinformatics, implemented-in::c, ユーザインタフェース: コマンドライン, 役割: role::devel-lib, role::program, ソースコード, 目的: use::comparing, works-with::biological-sequence

その他の libbwa-dev 関連パッケージ

• sug: samtools

  processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

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アーキテクチャ	バージョン	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
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arm64	0.7.18-1	147.0 kB	472.0 kB	[ファイル一覧]
armel	0.7.18-1	147.3 kB	435.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	0.7.18-1	147.3 kB	365.0 kB	[ファイル一覧]
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mips64el	0.7.18-1	160.8 kB	568.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64 (非公式の移植版)	0.7.18-1	165.0 kB	554.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	0.7.18-1	173.8 kB	567.0 kB	[ファイル一覧]
riscv64	0.7.18-1	300.8 kB	2,340.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	0.7.18-1	165.3 kB	519.0 kB	[ファイル一覧]
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sparc64 (非公式の移植版)	0.7.18-1	140.9 kB	482.0 kB	[ファイル一覧]
x32 (非公式の移植版)	0.7.18-1	155.4 kB	447.0 kB	[ファイル一覧]