Пакет: tombo (1.5.1-2 и други)

[ Източник: tombo  ]

identification of modified nucleotides from raw nanopore sequencing data

Tombo is a suite of tools primarily for the identification of modified nucleotides from nanopore sequencing data. Tombo also provides tools for the analysis and visualization of raw nanopore signal.

Други пакети, свързани с tombo

• dep: cython3

  C-Extensions for Python 3

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  GCC support library

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel]

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

  dep: python3 (<< 3.10)

  dep: python3 (>= 3.9~)

• dep: python3-h5py

  general-purpose Python interface to hdf5

• dep: python3-h5py-serial

  general-purpose Python interface to hdf5 (Python 3 serial)

• dep: python3-mappy

  Python3 interface minimap2

• dep: python3-numpy

  Fast array facility to the Python 3 language

• dep: python3-pkg-resources

  Package Discovery and Resource Access using pkg_resources

• dep: python3-scipy

  scientific tools for Python 3

• dep: python3-tqdm

  fast, extensible progress bar for Python 3 and CLI tool

• rec: python3-pyfaidx

  efficient random access to fasta subsequences for Python 3

• rec: python3-rpy2

  Python3 interface to the GNU R language and environment (version 2)
  също и виртуален пакет, предлаган от python3-rpy2

Изтегляне на tombo

Изтегляне за всички налични архитектури

Архитектура	Версия	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
amd64	1.5.1-2+b2	421,8 кБ	1 424,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	1.5.1-2+b2	410,8 кБ	1 395,0 кБ	[списък на файловете]
armel	1.5.1-2+b2	411,9 кБ	1 387,0 кБ	[списък на файловете]
armhf	1.5.1-2+b2	412,9 кБ	1 324,0 кБ	[списък на файловете]
i386	1.5.1-2+b2	423,4 кБ	1 440,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	1.5.1-2+b2	408,6 кБ	1 449,0 кБ	[списък на файловете]
mipsel	1.5.1-2+b2	413,9 кБ	1 408,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	1.5.1-2+b2	421,1 кБ	1 496,0 кБ	[списък на файловете]
s390x	1.5.1-2+b2	408,9 кБ	1 419,0 кБ	[списък на файловете]