パッケージ: tombo (1.5.1-2 など)

[ ソース: tombo  ]

identification of modified nucleotides from raw nanopore sequencing data

Tombo is a suite of tools primarily for the identification of modified nucleotides from nanopore sequencing data. Tombo also provides tools for the analysis and visualization of raw nanopore signal.

その他の tombo 関連パッケージ

• dep: cython3

  C-Extensions for Python 3

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  GCC 共有ライブラリ

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel]

• dep: python3

  対話式の高レベルオブジェクト指向言語 (デフォルト python3 バージョン)

  dep: python3 (<< 3.10)

  dep: python3 (>= 3.9~)

• dep: python3-h5py

  general-purpose Python interface to hdf5

• dep: python3-h5py-serial

  general-purpose Python interface to hdf5 (Python 3 serial)

• dep: python3-mappy

  Python3 interface minimap2

• dep: python3-numpy

  Fast array facility to the Python 3 language

• dep: python3-pkg-resources

  pkg_resources を用いたパッケージ検索およびリソースアクセス

• dep: python3-scipy

  scientific tools for Python 3

• dep: python3-tqdm

  fast, extensible progress bar for Python 3 and CLI tool

• rec: python3-pyfaidx

  efficient random access to fasta subsequences for Python 3

• rec: python3-rpy2

  Python3 interface to the GNU R language and environment (version 2)
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: python3-rpy2

tombo のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	バージョン	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
amd64	1.5.1-2+b2	421.8 kB	1,424.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	1.5.1-2+b2	410.8 kB	1,395.0 kB	[ファイル一覧]
armel	1.5.1-2+b2	411.9 kB	1,387.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	1.5.1-2+b2	412.9 kB	1,324.0 kB	[ファイル一覧]
i386	1.5.1-2+b2	423.4 kB	1,440.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	1.5.1-2+b2	408.6 kB	1,449.0 kB	[ファイル一覧]
mipsel	1.5.1-2+b2	413.9 kB	1,408.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	1.5.1-2+b2	421.1 kB	1,496.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	1.5.1-2+b2	408.9 kB	1,419.0 kB	[ファイル一覧]