Paketti: delly (1.1.8-1 ja muut)

[ Source: delly  ]

Structural variant discovery by read analysis

Delly performs Structural variant discovery by integrated paired-end and split-read analysis. It discovers, genotypes and visualizes deletions, tandem duplications, inversions and translocations at single-nucleotide resolution in short-read massively parallel sequencing data. It uses paired-ends, split-reads and read-depth to sensitively and accurately delineate genomic rearrangements throughout the genome.

Muut pakettiin delly liittyvät paketit

• dep: libboost-filesystem1.83.0 (>= 1.83.0)

  filesystem operations (portable paths, iteration over directories, etc) in C++

• dep: libboost-iostreams1.83.0 (>= 1.83.0)

  Boost.Iostreams -kirjasto

• dep: libboost-program-options1.83.0 (>= 1.83.0)

  program options library for C++

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [arm64, ppc64el, s390x]

  GCC:n apukirjasto

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [amd64, mips64el, riscv64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 7) [i386]

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  GCC OpenMP (GOMP) support library

• dep: libhts3t64 (>= 1.17)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [ei arm64]

  GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3

  dep: libstdc++6 (>= 14) [arm64]

Imuroi delly

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Versio	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
amd64	1.1.8-1+b2	394.0 kt	1,200.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	1.1.8-1+b3	355.5 kt	1,172.0 kt	[tiedostoluettelo]
armel	1.1.8-1+b2	318.5 kt	1,027.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	1.1.8-1+b2	329.8 kt	723.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	1.1.8-1+b2	419.1 kt	1,251.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	1.1.8-1+b2	354.5 kt	1,474.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	1.1.8-1+b2	386.6 kt	1,364.0 kt	[tiedostoluettelo]
riscv64	1.1.8-1+b2	382.7 kt	884.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	1.1.8-1+b2	399.0 kt	1,280.0 kt	[tiedostoluettelo]