パッケージ: delly (1.1.8-1 など)

[ ソース: delly  ]

Structural variant discovery by read analysis

Delly performs Structural variant discovery by integrated paired-end and split-read analysis. It discovers, genotypes and visualizes deletions, tandem duplications, inversions and translocations at single-nucleotide resolution in short-read massively parallel sequencing data. It uses paired-ends, split-reads and read-depth to sensitively and accurately delineate genomic rearrangements throughout the genome.

その他の delly 関連パッケージ

• dep: libboost-filesystem1.83.0 (>= 1.83.0)

  C++ でのファイルシステム操作 (ポータブルなパス、ディレクトリの列挙など)

• dep: libboost-iostreams1.83.0 (>= 1.83.0)

  Boost.Iostreams ライブラリ

• dep: libboost-program-options1.83.0 (>= 1.83.0)

  C++ 用プログラムオプションライブラリ

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [arm64, ppc64el, s390x]

  GCC 共有ライブラリ

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [amd64, mips64el, riscv64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 7) [i386]

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  GCC OpenMP (GOMP) サポートライブラリ

• dep: libhts3t64 (>= 1.17)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [arm64 以外]

  GNU 標準 C++ ライブラリ v3

  dep: libstdc++6 (>= 14) [arm64]

delly のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	バージョン	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
amd64	1.1.8-1+b2	394.0 kB	1,200.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	1.1.8-1+b3	355.5 kB	1,172.0 kB	[ファイル一覧]
armel	1.1.8-1+b2	318.5 kB	1,027.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	1.1.8-1+b2	329.8 kB	723.0 kB	[ファイル一覧]
i386	1.1.8-1+b2	419.1 kB	1,251.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	1.1.8-1+b2	354.5 kB	1,474.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	1.1.8-1+b2	386.6 kB	1,364.0 kB	[ファイル一覧]
riscv64	1.1.8-1+b2	382.7 kB	884.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	1.1.8-1+b2	399.0 kB	1,280.0 kB	[ファイル一覧]