Пакунок: delly (1.1.8-1 and others)

[ Source: delly  ]

Structural variant discovery by read analysis

Delly performs Structural variant discovery by integrated paired-end and split-read analysis. It discovers, genotypes and visualizes deletions, tandem duplications, inversions and translocations at single-nucleotide resolution in short-read massively parallel sequencing data. It uses paired-ends, split-reads and read-depth to sensitively and accurately delineate genomic rearrangements throughout the genome.

Інші пакунки пов'язані з delly

• dep: libboost-filesystem1.83.0 (>= 1.83.0)

  Операції з файловою системою (переносимі шляхи, операції з теками тощо) на Сі++

• dep: libboost-iostreams1.83.0 (>= 1.83.0)

  Бібліотека Boost.Iostreams

• dep: libboost-program-options1.83.0 (>= 1.83.0)

  Бібліотека параметрів програми на Сі++

• dep: libc6 (>= 2.34)

  Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [arm64, ppc64el, s390x]

  Допоміжна бібліотека GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [amd64, mips64el, riscv64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 7) [i386]

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  Підтримувальна бібліотека GCC OpenMP (GOMP)

• dep: libhts3t64 (>= 1.17)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [not arm64]

  Стандартна бібліотека C++ GNU, версії 3

  dep: libstdc++6 (>= 14) [arm64]

Завантажити delly

Завантаження для всіх доступних архітектур

Архітектура	Версія	Розмір пакунка	Розмір після встановлення	Файли
amd64	1.1.8-1+b2	394.0 kB	1,200.0 kB	[список файлів]
arm64	1.1.8-1+b3	355.5 kB	1,172.0 kB	[список файлів]
armel	1.1.8-1+b2	318.5 kB	1,027.0 kB	[список файлів]
armhf	1.1.8-1+b2	329.8 kB	723.0 kB	[список файлів]
i386	1.1.8-1+b2	419.1 kB	1,251.0 kB	[список файлів]
mips64el	1.1.8-1+b2	354.5 kB	1,474.0 kB	[список файлів]
ppc64el	1.1.8-1+b2	386.6 kB	1,364.0 kB	[список файлів]
riscv64	1.1.8-1+b2	382.7 kB	884.0 kB	[список файлів]
s390x	1.1.8-1+b2	399.0 kB	1,280.0 kB	[список файлів]