Paketti: delly (1.1.6-1)

[ Source: delly  ]

Structural variant discovery by read analysis

Delly performs Structural variant discovery by integrated paired-end and split-read analysis. It discovers, genotypes and visualizes deletions, tandem duplications, inversions and translocations at single-nucleotide resolution in short-read massively parallel sequencing data. It uses paired-ends, split-reads and read-depth to sensitively and accurately delineate genomic rearrangements throughout the genome.

Muut pakettiin delly liittyvät paketit

• dep: libboost-filesystem1.74.0 (>= 1.74.0)

  filesystem operations (portable paths, iteration over directories, etc) in C++

• dep: libboost-iostreams1.74.0 (>= 1.74.0)

  Boost.Iostreams -kirjasto

• dep: libboost-program-options1.74.0 (>= 1.74.0)

  program options library for C++

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [arm64, ppc64el, s390x]

  GCC:n apukirjasto

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [amd64, mips64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [mipsel]

  dep: libgcc-s1 (>= 7) [i386]

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  GCC OpenMP (GOMP) support library

• dep: libhts3 (>= 1.10)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3

Imuroi delly

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
amd64	321.3 kt	987.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	277.9 kt	915.0 kt	[tiedostoluettelo]
armel	258.1 kt	850.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	266.4 kt	594.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	338.6 kt	1,042.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	293.6 kt	1,207.0 kt	[tiedostoluettelo]
mipsel	296.6 kt	1,203.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	320.5 kt	1,171.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	291.7 kt	1,027.0 kt	[tiedostoluettelo]