Paket: delly (1.1.8-1 und andere)

[ Quellcode: delly  ]

Structural variant discovery by read analysis

Delly performs Structural variant discovery by integrated paired-end and split-read analysis. It discovers, genotypes and visualizes deletions, tandem duplications, inversions and translocations at single-nucleotide resolution in short-read massively parallel sequencing data. It uses paired-ends, split-reads and read-depth to sensitively and accurately delineate genomic rearrangements throughout the genome.

Andere Pakete mit Bezug zu delly

• dep: libboost-filesystem1.83.0 (>= 1.83.0)

  Dateisystemoperationen (portable Pfade, Iterationen über Verzeichnisse, usw.) in C++

• dep: libboost-iostreams1.83.0 (>= 1.83.0)

  Boost.Iostreams-Bibliothek

• dep: libboost-program-options1.83.0 (>= 1.83.0)

  C++-Bibliothek für Programmoptionen

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [arm64, ppc64el, s390x]

  GCC Support-Bibliothek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [amd64, mips64el, riscv64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 7) [i386]

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  Unterstützungsbibliothek für GCC OpenMP (GOMP)

• dep: libhts3t64 (>= 1.17)

  C-Bibliothek für Hochdurchsatz-Sequenzierungsdatenformate

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [nicht arm64]

  GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

  dep: libstdc++6 (>= 14) [arm64]

delly herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
amd64	1.1.8-1+b2	394,0 kB	1.200,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	1.1.8-1+b3	355,5 kB	1.172,0 kB	[Liste der Dateien]
armel	1.1.8-1+b2	318,5 kB	1.027,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	1.1.8-1+b2	329,8 kB	723,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	1.1.8-1+b2	419,1 kB	1.251,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	1.1.8-1+b2	354,5 kB	1.474,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	1.1.8-1+b2	386,6 kB	1.364,0 kB	[Liste der Dateien]
riscv64	1.1.8-1+b2	382,7 kB	884,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	1.1.8-1+b2	399,0 kB	1.280,0 kB	[Liste der Dateien]