Paketti: nast-ier (20101212+dfsg1-5)

[ Source: microbiomeutil  ]

NAST-based DNA alignment tool

The NAST-iEr alignment utility aligns a single raw nucleotide sequence against one or more NAST formatted sequences.

The alignment algorithm involves global dynamic programming profile alignment to fixed (NAST-formatted) multiply aligned template sequences without any end-gap penalty.

NAST-iEr is part of the microbiomeutil suite.

Muut pakettiin nast-ier liittyvät paketit

• dep: cdbfasta

  Constant DataBase indexing and retrieval tools for multi-FASTA files

• dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.4) [ei arm64, ppc64el]

• dep: microbiomeutil-data

  Reference 16S sequences and NAST-alignments used by microbiomeutil tools

• rec: ncbi-blast+

  next generation suite of BLAST sequence search tools

Imuroi nast-ier

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
amd64	21.0 kt	101.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	20.7 kt	96.0 kt	[tiedostoluettelo]
armel	20.3 kt	96.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	20.1 kt	92.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	21.3 kt	100.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	21.4 kt	102.0 kt	[tiedostoluettelo]
mipsel	21.2 kt	97.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	21.9 kt	149.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	20.9 kt	100.0 kt	[tiedostoluettelo]