Paketti: snpomatic (1.0-7 ja muut)

[ Source: snpomatic  ]

fast, stringent short-read mapping software

High throughput sequencing technologies generate large amounts of short reads. Mapping these to a reference sequence consumes large amounts of processing time and memory, and read mapping errors can lead to noisy or incorrect alignments.

SNP-o-matic is a fast, stringent short-read mapping software. It supports a multitude of output types and formats, for uses in filtering reads, alignments, sequence-based genotyping calls, assisted reassembly of contigs etc.

Tagit: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: use::comparing, works-with::biological-sequence

Muut pakettiin snpomatic liittyvät paketit

• dep: libc6 (>= 2.34) [ei arm64]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.38) [arm64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [ei armel, armhf, riscv64]

  GCC:n apukirjasto

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [riscv64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3

Imuroi snpomatic

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Versio	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
amd64	1.0-7	83.6 kt	208.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	1.0-7+b1	72.4 kt	217.0 kt	[tiedostoluettelo]
armel	1.0-7	66.4 kt	167.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	1.0-7	67.5 kt	127.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	1.0-7	85.9 kt	211.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	1.0-7	74.8 kt	222.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	1.0-7	82.2 kt	216.0 kt	[tiedostoluettelo]
riscv64	1.0-7	77.9 kt	156.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	1.0-7	79.3 kt	204.0 kt	[tiedostoluettelo]