Paketti: spoa (4.0.8-1)

[ Source: spoa  ]

SIMD partial order alignment tool

Spoa (SIMD POA) is a c++ implementation of the partial order alignment (POA) algorithm (as described in 10.1093/bioinformatics/18.3.452) which is used to generate consensus sequences (as described in 10.1093/bioinformatics/btg109). It supports three alignment modes: local (Smith-Waterman), global (Needleman-Wunsch) and semi-global alignment (overlap).

Muut pakettiin spoa liittyvät paketit

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [ei armel, armhf]

  GCC:n apukirjasto

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libspoa7.0.0 (>= 4.0.5) [amd64]

  SIMD partial order alignment library

  dep: libspoa7.0.0 (>= 4.0.8) [ei amd64]

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  pakkauskirjaston ajonaikaistiedostot

Imuroi spoa

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
amd64	35.2 kt	74.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	34.2 kt	98.0 kt	[tiedostoluettelo]
armel	33.1 kt	97.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	32.6 kt	97.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	35.6 kt	73.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	34.8 kt	100.0 kt	[tiedostoluettelo]
mipsel	34.7 kt	99.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	36.0 kt	98.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	34.2 kt	74.0 kt	[tiedostoluettelo]