Pacote: spoa (4.0.8-1)

[ Fonte: spoa  ]

SIMD partial order alignment tool

Spoa (SIMD POA) is a c++ implementation of the partial order alignment (POA) algorithm (as described in 10.1093/bioinformatics/18.3.452) which is used to generate consensus sequences (as described in 10.1093/bioinformatics/btg109). It supports three alignment modes: local (Smith-Waterman), global (Needleman-Wunsch) and semi-global alignment (overlap).

Outros pacotes relacionados a spoa

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [não armel, armhf]

  Biblioteca de suporte GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libspoa7.0.0 (>= 4.0.5) [amd64]

  SIMD partial order alignment library

  dep: libspoa7.0.0 (>= 4.0.8) [não amd64]

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  Biblioteca C++ padrão da GNU v3

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  biblioteca de compressão - runtime (tempo de execução)

Download de spoa

Baixe para todas as arquiteturas disponíveis

Arquitetura	Tamanho do pacote	Tamanho instalado	Arquivos
amd64	35.2 kB	74.0 kB	[lista de arquivos]
arm64	34.2 kB	98.0 kB	[lista de arquivos]
armel	33.1 kB	97.0 kB	[lista de arquivos]
armhf	32.6 kB	97.0 kB	[lista de arquivos]
i386	35.6 kB	73.0 kB	[lista de arquivos]
mips64el	34.8 kB	100.0 kB	[lista de arquivos]
mipsel	34.7 kB	99.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64el	36.0 kB	98.0 kB	[lista de arquivos]
s390x	34.2 kB	74.0 kB	[lista de arquivos]