Pakket: spoa (4.0.8-1)

[ Bron: spoa  ]

SIMD partial order alignment tool

Spoa (SIMD POA) is a c++ implementation of the partial order alignment (POA) algorithm (as described in 10.1093/bioinformatics/18.3.452) which is used to generate consensus sequences (as described in 10.1093/bioinformatics/btg109). It supports three alignment modes: local (Smith-Waterman), global (Needleman-Wunsch) and semi-global alignment (overlap).

Andere aan spoa gerelateerde pakketten

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU C Bibliotheek: Gedeelde bibliotheken
  Ook een virtueel pakket geboden door: libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [niet armel, armhf]

  GCC support bibliotheek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libspoa7.0.0 (>= 4.0.5) [amd64]

  SIMD partial order alignment library

  dep: libspoa7.0.0 (>= 4.0.8) [niet amd64]

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  GNU Standard C++ Library v3

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  compressiebibliotheek - programma's

spoa downloaden

Pakket downloaden voor alle beschikbare platforms

Platform	Pakketgrootte	Geïnstalleerde grootte	Bestanden
amd64	35,2 kB	74,0 kB	[overzicht]
arm64	34,2 kB	98,0 kB	[overzicht]
armel	33,1 kB	97,0 kB	[overzicht]
armhf	32,6 kB	97,0 kB	[overzicht]
i386	35,6 kB	73,0 kB	[overzicht]
mips64el	34,8 kB	100,0 kB	[overzicht]
mipsel	34,7 kB	99,0 kB	[overzicht]
ppc64el	36,0 kB	98,0 kB	[overzicht]
s390x	34,2 kB	74,0 kB	[overzicht]