Paketti: spoa (4.0.7+ds-1 ja muut)

[ Source: spoa  ]

SIMD partial order alignment tool

Spoa (SIMD POA) is a c++ implementation of the partial order alignment (POA) algorithm (as described in 10.1093/bioinformatics/18.3.452) which is used to generate consensus sequences (as described in 10.1093/bioinformatics/btg109). It supports three alignment modes: local (Smith-Waterman), global (Needleman-Wunsch) and semi-global alignment (overlap).

Muut pakettiin spoa liittyvät paketit

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.4) [ei amd64, arm64, ppc64el]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [ei armel, armhf]

  GCC:n apukirjasto

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libspoa7.0.0 (>= 4.0.5+ds) [amd64]

  SIMD partial order alignment library

  dep: libspoa7.0.0 (>= 4.0.7+ds) [ei amd64]

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  pakkauskirjaston ajonaikaistiedostot

Imuroi spoa

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Versio	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
amd64	4.0.7+ds-1+b1	37.1 kt	79.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	4.0.7+ds-1+b1	35.9 kt	75.0 kt	[tiedostoluettelo]
armel	4.0.7+ds-1+b1	34.9 kt	74.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	4.0.7+ds-1+b1	34.4 kt	62.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	4.0.7+ds-1+b1	37.8 kt	78.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	4.0.7+ds-1+b1	36.7 kt	85.0 kt	[tiedostoluettelo]
mipsel	4.0.7+ds-1+b1	36.3 kt	80.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	4.0.7+ds-1+b1	38.0 kt	99.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	4.0.7+ds-1+b1	36.0 kt	79.0 kt	[tiedostoluettelo]