[ Source: spoa ]
Paketti: spoa (4.0.7+ds-1 ja muut)
Links for spoa
Debian-palvelut:
Imuroi lähdekoodipaketti spoa:
Ylläpitäjät:
External Resources:
- Kotisivu [github.com]
Samankaltaisia paketteja:
SIMD partial order alignment tool
Spoa (SIMD POA) is a c++ implementation of the partial order alignment (POA) algorithm (as described in 10.1093/bioinformatics/18.3.452) which is used to generate consensus sequences (as described in 10.1093/bioinformatics/btg109). It supports three alignment modes: local (Smith-Waterman), global (Needleman-Wunsch) and semi-global alignment (overlap).
Muut pakettiin spoa liittyvät paketit
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]
- GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]
- dep: libc6 (>= 2.4) [ei amd64, arm64, ppc64el]
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [ei armel, armhf]
- GCC:n apukirjasto
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
-
- dep: libspoa7.0.0 (>= 4.0.5+ds) [amd64]
- SIMD partial order alignment library
- dep: libspoa7.0.0 (>= 4.0.7+ds) [ei amd64]
-
- dep: libstdc++6 (>= 5.2)
- GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- pakkauskirjaston ajonaikaistiedostot
Imuroi spoa
Arkkitehtuuri | Versio | Paketin koko | Koko asennettuna | Tiedostot |
---|---|---|---|---|
amd64 | 4.0.7+ds-1+b1 | 37.1 kt | 79.0 kt | [tiedostoluettelo] |
arm64 | 4.0.7+ds-1+b1 | 35.9 kt | 75.0 kt | [tiedostoluettelo] |
armel | 4.0.7+ds-1+b1 | 34.9 kt | 74.0 kt | [tiedostoluettelo] |
armhf | 4.0.7+ds-1+b1 | 34.4 kt | 62.0 kt | [tiedostoluettelo] |
i386 | 4.0.7+ds-1+b1 | 37.8 kt | 78.0 kt | [tiedostoluettelo] |
mips64el | 4.0.7+ds-1+b1 | 36.7 kt | 85.0 kt | [tiedostoluettelo] |
mipsel | 4.0.7+ds-1+b1 | 36.3 kt | 80.0 kt | [tiedostoluettelo] |
ppc64el | 4.0.7+ds-1+b1 | 38.0 kt | 99.0 kt | [tiedostoluettelo] |
s390x | 4.0.7+ds-1+b1 | 36.0 kt | 79.0 kt | [tiedostoluettelo] |