[ Source: spoa ]
Paketti: spoa (4.1.4-2 ja muut)
Links for spoa
Debian-palvelut:
Imuroi lähdekoodipaketti spoa:
Ylläpitäjät:
- Debian Med Packaging Team (Laadunvalvontasivu, Mail Archive)
- Andreas Tille (Laadunvalvontasivu)
- Étienne Mollier (Laadunvalvontasivu)
External Resources:
- Kotisivu [github.com]
Samankaltaisia paketteja:
SIMD partial order alignment tool
Spoa (SIMD POA) is a c++ implementation of the partial order alignment (POA) algorithm (as described in 10.1093/bioinformatics/18.3.452) which is used to generate consensus sequences (as described in 10.1093/bioinformatics/btg109). It supports three alignment modes: local (Smith-Waterman), global (Needleman-Wunsch) and semi-global alignment (overlap).
Muut pakettiin spoa liittyvät paketit
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.38) [ei alpha, ia64, sh4]
- GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]
-
- dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
- GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [ei armel, armhf, hppa, ia64, m68k]
- GCC:n apukirjasto
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
-
- dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]
- GCC:n apukirjasto
-
- dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]
- GCC:n apukirjasto
-
- dep: libspoa7.0.0 (>= 4.1.4)
- SIMD partial order alignment library
-
- dep: libstdc++6 (>= 13.1)
- GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3
-
- dep: libunwind8 [ia64]
- library to determine the call-chain of a program - runtime
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [ei armel, armhf, hppa, m68k, sh4]
- pakkauskirjaston ajonaikaistiedostot
- dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3) [armel, armhf, hppa, m68k, sh4]
Imuroi spoa
Arkkitehtuuri | Versio | Paketin koko | Koko asennettuna | Tiedostot |
---|---|---|---|---|
alpha (epävirallinen siirros) | 4.1.4-2 | 35.9 kt | 98.0 kt | [tiedostoluettelo] |
amd64 | 4.1.4-2+b1 | 37.4 kt | 79.0 kt | [tiedostoluettelo] |
arm64 | 4.1.4-2+b1 | 36.1 kt | 99.0 kt | [tiedostoluettelo] |
armel | 4.1.4-2+b1 | 34.7 kt | 74.0 kt | [tiedostoluettelo] |
armhf | 4.1.4-2+b1 | 34.2 kt | 62.0 kt | [tiedostoluettelo] |
hppa (epävirallinen siirros) | 4.1.4-2+b1 | 37.4 kt | 79.0 kt | [tiedostoluettelo] |
i386 | 4.1.4-2+b1 | 37.8 kt | 78.0 kt | [tiedostoluettelo] |
ia64 (epävirallinen siirros) | 4.1.4-1 | 41.3 kt | 106.0 kt | [tiedostoluettelo] |
m68k (epävirallinen siirros) | 4.1.4-2+b1 | 36.1 kt | 74.0 kt | [tiedostoluettelo] |
mips64el | 4.1.4-2+b1 | 36.2 kt | 101.0 kt | [tiedostoluettelo] |
ppc64 (epävirallinen siirros) | 4.1.4-2+b1 | 36.8 kt | 99.0 kt | [tiedostoluettelo] |
ppc64el | 4.1.4-2+b1 | 37.5 kt | 99.0 kt | [tiedostoluettelo] |
riscv64 | 4.1.4-2+b1 | 35.9 kt | 67.0 kt | [tiedostoluettelo] |
s390x | 4.1.4-2+b1 | 37.2 kt | 79.0 kt | [tiedostoluettelo] |
sh4 (epävirallinen siirros) | 4.1.4-2+b1 | 38.7 kt | 98.0 kt | [tiedostoluettelo] |
sparc64 (epävirallinen siirros) | 4.1.4-2+b1 | 34.8 kt | 1,061.0 kt | [tiedostoluettelo] |
x32 (epävirallinen siirros) | 4.1.4-2+b1 | 37.3 kt | 78.0 kt | [tiedostoluettelo] |