Paket: ssw-align (1.1-13)

[ Quellcode: libssw  ]

Smith-Waterman aligner based on libssw

This package provides a command-line aligner based on the libssw library, a fast SIMD accelerated implementation of the Smith-Waterman algorithm. The input files can be in FASTA or FASTQ format. Both target and query files can contain multiple sequences. Each sequence in the query file will be aligned with all sequences in the target file. Output is provided in SAM or BLAST-like text format.

Andere Pakete mit Bezug zu ssw-align

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

• dep: libssw0 (= 1.1-13)

  fast SIMD parallelized implementation of the Smith-Waterman algorithm

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Kompressions-Bibliothek - Laufzeit

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Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
amd64	20,7 kB	54,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	19,7 kB	50,0 kB	[Liste der Dateien]
armel	23,9 kB	66,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	22,0 kB	50,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	27,7 kB	82,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	27,9 kB	76,0 kB	[Liste der Dateien]
mipsel	27,3 kB	71,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	20,5 kB	83,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	25,3 kB	75,0 kB	[Liste der Dateien]