Paket: clustalw (2.1+lgpl-7 und andere)
Links für clustalw
Debian-Ressourcen:
Quellcode-Paket clustalw herunterladen:
Betreuer:
- Debian Med Packaging Team (QS-Seite, E-Mail-Archiv)
- Steffen Moeller (QS-Seite)
- Charles Plessy (QS-Seite)
- Andreas Tille (QS-Seite)
Externe Ressourcen:
- Homepage [www.clustal.org]
Ähnliche Pakete:
Globale multiple Alignments von Nukleotid- oder Peptidsequenzen
Clustal W führt ein Alignment mehrerer Nukleotid- oder Aminosäurensequenzen aus. Das Programm erkennt das Format der Eingabesequenzen und ob die Sequenzen aus Nuklein- (DNA/RNA) oder Aminosäuren (Proteine) bestehen. Das Ausgabeformat kann aus verschiedenen Formaten für multiple Alignments ausgewählt werden, etwa Phylip oder FASTA. Clustal W ist allgemein anerkannt.
Die Ausgabe von Clustal W kann händisch editiert werden, jedoch wird ein Alignment-Editor wie SeaView oder Clustal X empfohlen. Bei der Erstellung eines Modells aus Ihrem Alignment, kann die Ausgabe für verbesserte Datenbanksuchen verwendet werden. Das Debian-Paket hmmer erstellt dies mittels eines Hidden-Markov-Modells (HMM).
Andere Pakete mit Bezug zu clustalw
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- dep: libc6 (>= 2.29) [nicht alpha, ia64, riscv64, sh4]
- GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.31) [sh4]
- dep: libc6 (>= 2.34) [riscv64]
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- dep: libc6.1 (>= 2.29) [alpha]
- GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.31) [ia64]
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]
- GCC Support-Bibliothek
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]
-
- dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]
- GCC Support-Bibliothek
-
- dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]
- GCC Support-Bibliothek
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- dep: libstdc++6 (>= 13.1) [riscv64]
- GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)
- dep: libstdc++6 (>= 5.2) [nicht riscv64]
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- dep: libunwind8 [ia64]
- Bibliothek zur Ermittlung der Aufrufkette eines Programms - Laufzeit
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- sug: clustalx
- Multiples Alignment von Nukleotid- und Proteinsequenzen (grafische Oberfläche)
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- sug: seaview
- Multiplatform interface for sequence alignment and phylogeny
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- enh: bioperl-run
- BioPerl-Hüllen: Skripte
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- enh: emboss
- Europäische, quelloffene Software-Suite für Molekularbiologie
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- enh: t-coffee
- Multiple Sequence Alignment
clustalw herunterladen
Architektur | Version | Paketgröße | Größe (installiert) | Dateien |
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alpha (inoffizielle Portierung) | 2.1+lgpl-7 | 276,6 kB | 920,0 kB | [Liste der Dateien] |
amd64 | 2.1+lgpl-7 | 275,1 kB | 787,0 kB | [Liste der Dateien] |
arm64 | 2.1+lgpl-7 | 241,9 kB | 710,0 kB | [Liste der Dateien] |
hppa (inoffizielle Portierung) | 2.1+lgpl-7 | 259,6 kB | 737,0 kB | [Liste der Dateien] |
ia64 (inoffizielle Portierung) | 2.1+lgpl-7 | 344,9 kB | 1.516,0 kB | [Liste der Dateien] |
m68k (inoffizielle Portierung) | 2.1+lgpl-7 | 264,7 kB | 790,0 kB | [Liste der Dateien] |
mips64el | 2.1+lgpl-7 | 259,1 kB | 941,0 kB | [Liste der Dateien] |
ppc64 (inoffizielle Portierung) | 2.1+lgpl-7 | 276,1 kB | 982,0 kB | [Liste der Dateien] |
ppc64el | 2.1+lgpl-7 | 276,5 kB | 918,0 kB | [Liste der Dateien] |
riscv64 | 2.1+lgpl-7+b1 | 274,2 kB | 622,0 kB | [Liste der Dateien] |
s390x | 2.1+lgpl-7 | 247,5 kB | 794,0 kB | [Liste der Dateien] |
sh4 (inoffizielle Portierung) | 2.1+lgpl-7 | 314,8 kB | 714,0 kB | [Liste der Dateien] |
sparc64 (inoffizielle Portierung) | 2.1+lgpl-7 | 231,2 kB | 747,0 kB | [Liste der Dateien] |
x32 (inoffizielle Portierung) | 2.1+lgpl-7 | 275,3 kB | 750,0 kB | [Liste der Dateien] |