Package: mummer (3.23+dfsg-8 and others)
Links for mummer
Debian Resources:
Download Source Package mummer:
Maintainers:
- Debian Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
- Steffen Moeller (QA Page)
- Andreas Tille (QA Page)
- Charles Plessy (QA Page)
External Resources:
- Homepage [mummer.sourceforge.net]
Similar packages:
Effektiv sekvensjustering for hele genomer
MUMmer er et system til hurtig justering af hele genomer, uanset om det er i komplet eller udkastform. For eksempel kan MUMmer 3.0 finde alle eksakte sammenfald for 20-basepar eller længere mellem et par af 5-megabase genomer på 13,7 sekunder, med brug af 78MB hukommelse, på en stationær 2,4GHz Linux-maskine. MUMmer kan også justere genomer som ikke er komplette; den håndterer de hundrede- eller tusindevis af »contig'er« fra et »shotgun«- sekventeringsprojekt med lethed, og vil justere dem til et andet sæt af »contig'er« eller et genom med brug af NUCmer-programmet som er inkluderet i systemet. Hvis arterne er for divergerende til registrering af lighed gennem DNA-sekvensjustering, så kan PROmer-programmet danne justeringer baseret på »six-frame«-oversættelser af begge input-sekvenser.
Other Packages Related to mummer
|
|
|
|
-
- dep: gawk
- GNU awk, et mønsterscannings- og mønsterbehandlingssprog
-
- dep: libc6 (>= 2.34)
- GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
also a virtual package provided by libc6-udeb
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [not armel, armhf, riscv64]
- GCC støttebibliotek
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [riscv64]
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
-
- dep: libstdc++6 (>= 11) [not riscv64]
- GNU Standard C++ bibliotek v3
- dep: libstdc++6 (>= 13.1) [riscv64]
-
- dep: perl
- Larry Walls praktiske uddragnings- og rapportsprog (Perl)
Download mummer
Architecture | Version | Package Size | Installed Size | Files |
---|---|---|---|---|
amd64 | 3.23+dfsg-8 | 646.2 kB | 3,307.0 kB | [list of files] |
arm64 | 3.23+dfsg-8 | 621.2 kB | 3,826.0 kB | [list of files] |
armel | 3.23+dfsg-8 | 616.5 kB | 3,745.0 kB | [list of files] |
armhf | 3.23+dfsg-8 | 612.8 kB | 3,361.0 kB | [list of files] |
i386 | 3.23+dfsg-8 | 653.4 kB | 3,297.0 kB | [list of files] |
mips64el | 3.23+dfsg-8 | 651.6 kB | 4,009.0 kB | [list of files] |
ppc64el | 3.23+dfsg-8 | 655.8 kB | 4,019.0 kB | [list of files] |
riscv64 | 3.23+dfsg-8+b1 | 648.4 kB | 3,067.0 kB | [list of files] |
s390x | 3.23+dfsg-8 | 622.6 kB | 3,286.0 kB | [list of files] |