Package: mummer (3.23+dfsg-8 and others)
Links for mummer
Debian Resources:
Download Source Package mummer:
Maintainers:
- Debian Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
- Steffen Moeller (QA Page)
- Andreas Tille (QA Page)
- Charles Plessy (QA Page)
External Resources:
- Homepage [mummer.sourceforge.net]
Similar packages:
alinhamento eficiente de seqüência para genomas completos
O MUMmer é um sistema para rapidamente alinhar genomas inteiros, seja na forma completa ou rascunho ("draft"). Por exemplo, o MUMmer 3.0 pode encontrar todos os pares de base 20 ("20-basepair") ou combinações mais longas entre um par de 5-megabase de genomas em 13,7 segundos, usando 78 MB de memória, em uma estação de trabalho Linux 2.4 GHz. O MUMmer também pode alinhas genomas incompletos; ele lida com 100s ou 1000s de "contigs" a partir de um projeto de seqüenciamento "shotgun" com facilidade, e os alinhará para outro conjunto de "contigs" ou um genoma usando o programa NUCmer incluído com o sistema. Se a espécie for muito divergente do alinhamento da seqüência de DNA para detectar similaridade, então o programa PROmer pode gerar alinhamentos baseados em até transições de seis-quadros ("six-frame") de ambas as seqüências de entrada.
Other Packages Related to mummer
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- dep: gawk
- awk GNU, linguagem de varredura de padrões e processamento
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- dep: libc6 (>= 2.34)
- GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
also a virtual package provided by libc6-udeb
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- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
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- dep: libstdc++6 (>= 11) [not riscv64]
- Biblioteca C++ padrão da GNU v3
- dep: libstdc++6 (>= 13.1) [riscv64]
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- dep: perl
- Linguagem de extração e relatórios prática de Larry Wall
Download mummer
Architecture | Version | Package Size | Installed Size | Files |
---|---|---|---|---|
amd64 | 3.23+dfsg-8 | 646.2 kB | 3,307.0 kB | [list of files] |
arm64 | 3.23+dfsg-8 | 621.2 kB | 3,826.0 kB | [list of files] |
armel | 3.23+dfsg-8 | 616.5 kB | 3,745.0 kB | [list of files] |
armhf | 3.23+dfsg-8 | 612.8 kB | 3,361.0 kB | [list of files] |
i386 | 3.23+dfsg-8 | 653.4 kB | 3,297.0 kB | [list of files] |
mips64el | 3.23+dfsg-8 | 651.6 kB | 4,009.0 kB | [list of files] |
ppc64el | 3.23+dfsg-8 | 655.8 kB | 4,019.0 kB | [list of files] |
riscv64 | 3.23+dfsg-8+b1 | 648.4 kB | 3,067.0 kB | [list of files] |
s390x | 3.23+dfsg-8 | 622.6 kB | 3,286.0 kB | [list of files] |