Paquet : mummer (3.23+dfsg-8 et autres)
Liens pour mummer
Ressources Debian :
- Rapports de bogues
- Developer Information
- Journal des modifications Debian
- Fichier de licence
- Suivis des correctifs pour Debian
Télécharger le paquet source mummer :
Responsables :
- Debian Med Packaging Team (Page QA, Archive du courrier électronique)
- Steffen Moeller (Page QA)
- Andreas Tille (Page QA)
- Charles Plessy (Page QA)
Ressources externes :
- Page d'accueil [mummer.sourceforge.net]
Paquets similaires :
Alignement de séquence efficace de génomes complets
MUMmer a été conçu pour aligner rapidement des génomes entiers, bruts ou finis. Par exemple, MUMmer 3.0 peut trouver toutes les régions identiques sur plus de 20 paires de bases entre deux génomes de 5 mégabases en 13,7 secondes, sur un ordinateur tournant à 2.4 GHz en utilisant 78 Mo de mémoire. MUMmer peut aussi aligner des génomes incomplets ; il manipule les centaines ou les milliers de contigs d'un projet de séquençage « shotgun » avec aisance, et les alignera sur un autre génome ou une autre collection de contigs en utilisant le programme NUCmer, inclus dans le système. Si les génomes proviennent d'espèces trop différentes pour que des similarités soient détectées au niveau nucléotidique, le programme PROmer générera des alignements basés sur la traduction des six phases de lectures de chaque génome.
Autres paquets associés à mummer
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- dep: gawk
- GNU awk, langage de recherche de motif et de traitement
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- dep: libc6 (>= 2.34)
- bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
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- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [non armel, armhf, riscv64]
- bibliothèque de prise en charge de GCC
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [riscv64]
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
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- dep: libstdc++6 (>= 11) [non riscv64]
- bibliothèque standard C++ de GNU v3
- dep: libstdc++6 (>= 13.1) [riscv64]
-
- dep: perl
- langage de rapports et d'extractions pratiques de Larry Wall
Télécharger mummer
Architecture | Version | Taille du paquet | Espace occupé une fois installé | Fichiers |
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amd64 | 3.23+dfsg-8 | 646,2 ko | 3 307,0 ko | [liste des fichiers] |
arm64 | 3.23+dfsg-8 | 621,2 ko | 3 826,0 ko | [liste des fichiers] |
armel | 3.23+dfsg-8 | 616,5 ko | 3 745,0 ko | [liste des fichiers] |
armhf | 3.23+dfsg-8 | 612,8 ko | 3 361,0 ko | [liste des fichiers] |
i386 | 3.23+dfsg-8 | 653,4 ko | 3 297,0 ko | [liste des fichiers] |
mips64el | 3.23+dfsg-8 | 651,6 ko | 4 009,0 ko | [liste des fichiers] |
ppc64el | 3.23+dfsg-8 | 655,8 ko | 4 019,0 ko | [liste des fichiers] |
riscv64 | 3.23+dfsg-8+b1 | 648,4 ko | 3 067,0 ko | [liste des fichiers] |
s390x | 3.23+dfsg-8 | 622,6 ko | 3 286,0 ko | [liste des fichiers] |