Package: bali-phy (4.0~beta13+dfsg-1)

[ Source: bali-phy  ]

Experimental package

Warning: This package is from the experimental distribution. That means it is likely unstable or buggy, and it may even cause data loss. Please be sure to consult the changelog and other possible documentation before using it.

Bayesiansk inferens for justering og fylogeni

BAli-Phy estimerer flere sekvensjusteringer og evolutionære træer fra DNA uden justering, aminosyre eller codonsekvenser. BAli-Phy bruger MCMC til at estimere evolutionære træer, positiv markering og grenlængder mens der laves gennemsnit over alternative justeringer. BAli-Phy kan vise justeringstvetydighed grafisk i et justeringsusikkerhedsplot (AU).

Bali-Phy kan også estimere fylogenier fra en fast justering (såsom MrBayes og BEAST), der bruger substitionsmodeller såsom GTR+gamma. BAli- Phy estimerer automatisk relative hastigheder for hvert gen.

Other Packages Related to bali-phy

• dep: libboost-chrono1.83.0t64 (>= 1.83.0)

  C++-repræsentaton af tidsvarighed, tidspunkt og ure

• dep: libboost-json1.83.0 (>= 1.83.0)

  C++ containers and algorithms that implement JSON

• dep: libboost-program-options1.83.0 (>= 1.83.0)

  bibliotek til programindstillinger for C++

• dep: libboost-random1.83.0 (>= 1.83.0)

  Boost Random Number Library

• dep: libc6 (>= 2.38)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libcairo2 (>= 1.4.10)

  Cairo 2D - vektorgrafikbibliotek

• dep: libfmt9 (>= 9.1.0+ds1)

  Hurtigt type-sikkert C++-formateringsbibliotek - bibliotek

• dep: libgcc-s1 (>= 7)

  GCC støttebibliotek

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  GNU Standard C++ bibliotek v3

• dep: perl

  Larry Walls praktiske uddragnings- og rapportsprog (Perl)

• dep: python3

  Interaktivt objektorienteret højniveausprog - standardversion af Python 3

• rec: gnuplot

  Kommandolinjedrevet interaktivt grafprogram
  also a virtual package provided by gnuplot-nox, gnuplot-qt, gnuplot-x11

• rec: r-base

  GNU R statistisk beregning og grafiksystem

• sug: figtree

  Grafisk fylogenetisk træfremviser

• sug: seaview

  Grænseflade til flere platforme for sekvenssammenligning og fylogeni

Download bali-phy

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
i386	8,191.7 kB	45,415.0 kB	[list of files]