Package: bali-phy (3.6.1+dfsg-3)

[ Source: bali-phy  ]

Bayesiansk inferens for justering og fylogeni

BAli-Phy estimerer flere sekvensjusteringer og evolutionære træer fra DNA uden justering, aminosyre eller codonsekvenser. BAli-Phy bruger MCMC til at estimere evolutionære træer, positiv markering og grenlængder mens der laves gennemsnit over alternative justeringer. BAli-Phy kan vise justeringstvetydighed grafisk i et justeringsusikkerhedsplot (AU).

Bali-Phy kan også estimere fylogenier fra en fast justering (såsom MrBayes og BEAST), der bruger substitionsmodeller såsom GTR+gamma. BAli- Phy estimerer automatisk relative hastigheder for hvert gen.

Other Packages Related to bali-phy

• dep: libboost-chrono1.83.0t64 (>= 1.83.0)

  C++-repræsentaton af tidsvarighed, tidspunkt og ure

• dep: libboost-filesystem1.83.0 (>= 1.83.0)

  Filsystemhandlinger (flytbare stier, iteration over mappere etc.) i C++

• dep: libboost-program-options1.83.0 (>= 1.83.0)

  bibliotek til programindstillinger for C++

• dep: libboost-random1.83.0 (>= 1.83.0)

  Boost Random Number Library

• dep: libc6 (>= 2.38)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libcairo2 (>= 1.4.10)

  Cairo 2D - vektorgrafikbibliotek

• dep: libgcc-s1 (>= 4.2)

  GCC støttebibliotek

• dep: libstdc++6 (>= 14)

  GNU Standard C++ bibliotek v3

• dep: perl

  Larry Walls praktiske uddragnings- og rapportsprog (Perl)

• dep: python3

  Interaktivt objektorienteret højniveausprog - standardversion af Python 3

• rec: gnuplot

  Kommandolinjedrevet interaktivt grafprogram
  also a virtual package provided by gnuplot-nox, gnuplot-qt, gnuplot-x11

• rec: r-base

  GNU R statistisk beregning og grafiksystem

• sug: figtree

  Grafisk fylogenetisk træfremviser

• sug: seaview

  Grænseflade til flere platforme for sekvenssammenligning og fylogeni

Download bali-phy

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
i386	6,350.6 kB	37,805.0 kB	[list of files]