Package: velvet (1.2.10+dfsg1-7)
Links for velvet
Debian Resources:
Download Source Package velvet:
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [www.ebi.ac.uk]
Similar packages:
Sekvens-assembler for nukleinsyre til meget korte læsninger
Velvet er en »de novo«-genomisk assembler som er specielt designet for teknologier til kort læsning, såsom Solexa eller 454, udviklet af Daniel Zerbino og Ewan Birney ved European Bioinformatics Institue (EMBL-EBI), nær Cambridge, i Storbritannien.
Velvet kan i øjeblikket tage korte læsesekvenser, fjerner fejl og fremstiller dernæst unikke »contig'er« i høj kvalitet. Det anvender derefter parvis læseinformation, hvis tilgængelig, til at indhente de gentagne områder mellem contig'erne.
Other Packages Related to velvet
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.29)
- GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
also a virtual package provided by libc6-udeb
-
- dep: libgomp1 (>= 4.9)
- GCC OpenMP-understøttelsesbibliotek (GOMP)
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.2.0.2)
- Komprimeringsbibliotek - kørselstid
-
- sug: velvet-example
- Eksempeldata for sekvensassembleren Velvet
Download velvet
Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
---|---|---|---|
amd64 | 662.4 kB | 1,255.0 kB | [list of files] |
arm64 | 643.7 kB | 1,214.0 kB | [list of files] |
armel | 659.4 kB | 1,344.0 kB | [list of files] |
armhf | 645.5 kB | 1,049.0 kB | [list of files] |
i386 | 687.6 kB | 1,430.0 kB | [list of files] |
mips64el | 662.0 kB | 1,432.0 kB | [list of files] |
mipsel | 679.6 kB | 1,485.0 kB | [list of files] |
ppc64el | 672.3 kB | 1,586.0 kB | [list of files] |
s390x | 648.1 kB | 1,302.0 kB | [list of files] |