Package: miniasm (0.3+dfsg-4)
Links for miniasm
Debian Resources:
Download Source Package miniasm:
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [github.com]
Similar packages:
Ultrahurtig de novo assembler for lange støjfyldte DNA-sekvenslæsninger
Miniasm er en eksperimentel meget hurtig OLC-baseret de novo-assembler for støjfyldte lange læsninger. Den anvender alle-vs-alle læste egenoversættelser (typisk udført af minimap) som inddata og fremstiller en samlingsgraf i GFA-formatet. Forskellig fra de vigtigste assemblere da miniasm ikke har et koncensustrin. Programmet sammenkæder stykker af læste sekvenser for at oprette de endelige unitig-sekvenser. Dermed er per basis fejlraten lig de rå inddatalæsninger.
Other Packages Related to miniasm
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.34)
- GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
also a virtual package provided by libc6-udeb
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- Komprimeringsbibliotek - kørselstid
-
- rec: minimap
- Værktøj til omtrentlig oversættelse af lange biosekvenser såsom DNA-læsninger
Download miniasm
Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
---|---|---|---|
i386 | 31.2 kB | 78.0 kB | [list of files] |