Balík: miniasm (0.3+dfsg-4)
Odkazy pre miniasm
Zdroje Debian:
Stiahnuť zdrojový balík miniasm:
Správcovia:
Externé zdroje:
- Domovská stránka [github.com]
Podobné balíky:
ultrafast de novo assembler for long noisy DNA sequencing reads
Miniasm is an experimental very fast OLC-based de novo assembler for noisy long reads. It takes all-vs-all read self-mappings (typically by minimap) as input and outputs an assembly graph in the GFA format. Different from mainstream assemblers, miniasm does not have a consensus step. It simply concatenates pieces of read sequences to generate the final unitig sequences. Thus the per-base error rate is similar to the raw input reads.
Ostatné balíky súvisiace s balíkom miniasm
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.34)
- knižnica GNU C - zdieľané knižnice
tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- komprimačná knižnica - dynamická verzia
-
- rec: minimap
- tool for approximate mapping of long biosequences such as DNA reads
Stiahnuť miniasm
Architektúra | Veľkosť balíka | Nainštalovaná veľkosť | Súbory |
---|---|---|---|
i386 | 31.2 kB | 78.0 kB | [zoznam súborov] |