всички настройки
buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Източник: miniasm  ]

Пакет: miniasm (0.3+dfsg-4)

Връзки за miniasm

Screenshot

Ресурси за Debian:

Изтегляне на пакет-източник miniasm.

Отговорници:

Външни препратки:

Подобни пакети:

ultrafast de novo assembler for long noisy DNA sequencing reads

Miniasm is an experimental very fast OLC-based de novo assembler for noisy long reads. It takes all-vs-all read self-mappings (typically by minimap) as input and outputs an assembly graph in the GFA format. Different from mainstream assemblers, miniasm does not have a consensus step. It simply concatenates pieces of read sequences to generate the final unitig sequences. Thus the per-base error rate is similar to the raw input reads.

Етикети: Biology: Nucleic Acids, Field: Biology, field::biology:bioinformatics, implemented-in::c, User Interface: Command Line, Role: role::program, science::calculation, Purpose: Calculating, use::comparing, works-with::biological-sequence

Други пакети, свързани с miniasm

  • зависимости
  • препоръчани
  • предложени
  • enhances

Изтегляне на miniasm

Изтегляне за всички налични архитектури
Архитектура Големина на пакета Големина след инсталиране Файлове
i386 31,2 кБ78,0 кБ [списък на файловете]