Package: dnaclust (3-7 and others)

[ Source: dnaclust  ]

Værktøj til klyngedannelse af korte DNA-sekvenser

Dnaclust er et værktøj til klyngedannelse af et stort antal korte DNA-sekvenser. Klyngerne oprettes på en måde så »radiussen« for hver klynge ikke er større end den angivne tærskel.

Inddatasekvenserne der skal indgå i klyngedannelsen skal være i formatet Fasta. Id'en for hver sekvens er baseret på det første ord i sekvensen i formatet Fasta. Det første ord er præfikset for teksthovedet til den første forekomst af mellemrum i teksthovedet.

Tags: Biology: Fasta/Pearson, Nucleic Acids, Field: field::biology, field::biology:bioinformatics, Implemented in: C++, Role: role::program, works-with::biological-sequence

Other Packages Related to dnaclust

• dep: libboost-program-options1.74.0 (>= 1.74.0)

  bibliotek til programindstillinger for C++

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [not armel, armhf]

  GCC støttebibliotek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU Standard C++ bibliotek v3

Download dnaclust

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
amd64	3-7+b2	109.5 kB	677.0 kB	[list of files]
arm64	3-7+b2	101.6 kB	657.0 kB	[list of files]
armel	3-7+b2	98.4 kB	630.0 kB	[list of files]
armhf	3-7+b2	99.1 kB	574.0 kB	[list of files]
i386	3-7+b2	113.8 kB	674.0 kB	[list of files]
mips64el	3-7+b2	110.5 kB	748.0 kB	[list of files]
mipsel	3-7+b2	110.0 kB	723.0 kB	[list of files]
ppc64el	3-7+b2	113.4 kB	861.0 kB	[list of files]
s390x	3-7+b2	105.8 kB	689.0 kB	[list of files]