Пакет: dnaclust (3-7 и другие)

[ Источник: dnaclust  ]

tool for clustering millions of short DNA sequences

dnaclust is a tool for clustering large number of short DNA sequences. The clusters are created in such a way that the "radius" of each clusters is no more than the specified threshold.

The input sequences to be clustered should be in Fasta format. The id of each sequence is based on the first word of the seqeunce in the Fasta format. The first word is the prefix of the header up to the first occurrence of white space characters in the header.

Теги: Биология: Fasta/Pearson, Нуклеиновые кислоты, Область: field::biology, field::biology:bioinformatics, Реализовано на: C++, Роль: role::program, works-with::biological-sequence

Другие пакеты, относящиеся к dnaclust

• dep: libboost-program-options1.74.0 (>= 1.74.0)

  program options library for C++

• dep: libc6 (>= 2.29)

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [не armel, armhf]

  вспомогательная библиотека GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  стандартная библиотека GNU C++ версии 3

Загрузка dnaclust

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
amd64	3-7+b2	109,5 Кб	677,0 Кб	[список файлов]
arm64	3-7+b2	101,6 Кб	657,0 Кб	[список файлов]
armel	3-7+b2	98,4 Кб	630,0 Кб	[список файлов]
armhf	3-7+b2	99,1 Кб	574,0 Кб	[список файлов]
i386	3-7+b2	113,8 Кб	674,0 Кб	[список файлов]
mips64el	3-7+b2	110,5 Кб	748,0 Кб	[список файлов]
mipsel	3-7+b2	110,0 Кб	723,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	3-7+b2	113,4 Кб	861,0 Кб	[список файлов]
s390x	3-7+b2	105,8 Кб	689,0 Кб	[список файлов]