Package: dnaclust (3-7 and others)

[ Source: dnaclust  ]

Værktøj til klyngedannelse af korte DNA-sekvenser

Dnaclust er et værktøj til klyngedannelse af et stort antal korte DNA-sekvenser. Klyngerne oprettes på en måde så »radiussen« for hver klynge ikke er større end den angivne tærskel.

Inddatasekvenserne der skal indgå i klyngedannelsen skal være i formatet Fasta. Id'en for hver sekvens er baseret på det første ord i sekvensen i formatet Fasta. Det første ord er præfikset for teksthovedet til den første forekomst af mellemrum i teksthovedet.

Tags: Biology: Fasta/Pearson, Nucleic Acids, Field: field::biology, field::biology:bioinformatics, Implemented in: C++, Role: role::program, works-with::biological-sequence

Other Packages Related to dnaclust

• dep: libboost-program-options1.83.0 (>= 1.83.0)

  bibliotek til programindstillinger for C++

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [not armel, armhf, riscv64]

  GCC støttebibliotek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [riscv64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [not arm64]

  GNU Standard C++ bibliotek v3

  dep: libstdc++6 (>= 14) [arm64]

Download dnaclust

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
amd64	3-7+b3	111.9 kB	681.0 kB	[list of files]
arm64	3-7+b5	104.7 kB	733.0 kB	[list of files]
armel	3-7+b3	101.5 kB	646.0 kB	[list of files]
armhf	3-7+b3	101.2 kB	582.0 kB	[list of files]
i386	3-7+b3	115.6 kB	678.0 kB	[list of files]
mips64el	3-7+b3	112.2 kB	880.0 kB	[list of files]
ppc64el	3-7+b3	114.6 kB	861.0 kB	[list of files]
riscv64	3-7+b1	108.9 kB	629.0 kB	[list of files]
s390x	3-7+b3	115.3 kB	701.0 kB	[list of files]