Paquet : dnaclust (3-7 et autres)

[ Paquet source : dnaclust  ]

outil de regroupement de millions de séquences courtes d’ADN

Dnaclust est un outil pour grouper un grand nombre de séquences courtes d’ADN. Les regroupements sont créés de telle façon que le « rayon » de chaque regroupement est inférieur au seuil précisé.

Les séquences entrées pour être regroupées doivent être au format Fasta. L’identifiant de chaque séquence est basé sur le premier mot de la séquence au format Fasta. Le premier mot est le préfixe de l’en-tête jusqu’à la première occurrence d’une espace dans l’en-tête.

Étiquettes: Biologie: Fasta/Pearson, Acides nucléiques, Domaine: field::biology, field::biology:bioinformatics, Mis en œuvre en: C++, Rôle: role::program, works-with::biological-sequence

Autres paquets associés à dnaclust

• dep: libboost-program-options1.74.0 (>= 1.74.0)

  bibliothèque d'options de programmes pour C++

• dep: libc6 (>= 2.29)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [non armel, armhf]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

Télécharger dnaclust

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	3-7+b2	109,5 ko	677,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	3-7+b2	101,6 ko	657,0 ko	[liste des fichiers]
armel	3-7+b2	98,4 ko	630,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	3-7+b2	99,1 ko	574,0 ko	[liste des fichiers]
i386	3-7+b2	113,8 ko	674,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	3-7+b2	110,5 ko	748,0 ko	[liste des fichiers]
mipsel	3-7+b2	110,0 ko	723,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	3-7+b2	113,4 ko	861,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	3-7+b2	105,8 ko	689,0 ko	[liste des fichiers]