Пакет: r-bioc-pwalign (1.0.0-2)

[ Източник: r-bioc-pwalign  ]

Perform pairwise sequence alignments

The two main functions in the package are pairwiseAlignment() and stringDist(). The former solves (Needleman-Wunsch) global alignment, (Smith-Waterman) local alignment, and (ends-free) overlap alignment problems. The latter computes the Levenshtein edit distance or pairwise alignment score matrix for a set of strings.

Други пакети, свързани с r-bioc-pwalign

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.4) [mips64el, ppc64, s390x, sparc64]

• dep: libc6.1 (>= 2.1.3) [alpha]

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6.1-udeb

• dep: r-api-4.0

  виртуален пакет, предлаган от r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.19

  виртуален пакет, предлаган от r-bioc-biocgenerics

• dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.50.0)

  generic functions for Bioconductor

• dep: r-bioc-biostrings (>= 2.72.1)

  GNU R string objects representing biological sequences

• dep: r-bioc-iranges (>= 2.38.1)

  GNU R low-level containers for storing sets of integer ranges

• dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.42.1)

  BioConductor S4 implementation of vectors and lists

• dep: r-bioc-xvector (>= 0.44.0)

  BioConductor representation and manpulation of external sequences

• sug: r-cran-runit

  GNU R package providing unit testing framework

Изтегляне на r-bioc-pwalign

Изтегляне за всички налични архитектури

Архитектура	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
alpha (неофициална архитектура)	736,2 кБ	1 142,0 кБ	[списък на файловете]
amd64	737,3 кБ	1 103,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	735,8 кБ	1 143,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	734,3 кБ	1 151,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64 (неофициална архитектура)	739,3 кБ	1 207,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	737,8 кБ	1 143,0 кБ	[списък на файловете]
riscv64	736,6 кБ	1 087,0 кБ	[списък на файловете]
s390x	737,0 кБ	1 107,0 кБ	[списък на файловете]
sparc64 (неофициална архитектура)	732,3 кБ	2 039,0 кБ	[списък на файловете]