软件包：r-bioc-pwalign（1.0.0-2）

[ 源代码： r-bioc-pwalign  ]

Perform pairwise sequence alignments

The two main functions in the package are pairwiseAlignment() and stringDist(). The former solves (Needleman-Wunsch) global alignment, (Smith-Waterman) local alignment, and (ends-free) overlap alignment problems. The latter computes the Levenshtein edit distance or pairwise alignment score matrix for a set of strings.

其他与 r-bioc-pwalign 有关的软件包

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU C 语言运行库：共享库
  同时作为一个虚包由这些包填实： libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.4) [mips64el, ppc64, s390x, sparc64]

• dep: libc6.1 (>= 2.1.3) [alpha]

  GNU C 语言运行库：共享库
  同时作为一个虚包由这些包填实： libc6.1-udeb

• dep: r-api-4.0

  本虚包由这些包填实： r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.19

  本虚包由这些包填实： r-bioc-biocgenerics

• dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.50.0)

  generic functions for Bioconductor

• dep: r-bioc-biostrings (>= 2.72.1)

  GNU R string objects representing biological sequences

• dep: r-bioc-iranges (>= 2.38.1)

  GNU R low-level containers for storing sets of integer ranges

• dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.42.1)

  BioConductor S4 implementation of vectors and lists

• dep: r-bioc-xvector (>= 0.44.0)

  BioConductor representation and manpulation of external sequences

• sug: r-cran-runit

  GNU R package providing unit testing framework

下载 r-bioc-pwalign

下载可用于所有硬件架构的

硬件架构	软件包大小	安装后大小	文件
alpha （非官方移植版）	736.2 kB	1,142.0 kB	[文件列表]
amd64	737.3 kB	1,103.0 kB	[文件列表]
arm64	735.8 kB	1,143.0 kB	[文件列表]
mips64el	734.3 kB	1,151.0 kB	[文件列表]
ppc64 （非官方移植版）	739.3 kB	1,207.0 kB	[文件列表]
ppc64el	737.8 kB	1,143.0 kB	[文件列表]
riscv64	736.6 kB	1,087.0 kB	[文件列表]
s390x	737.0 kB	1,107.0 kB	[文件列表]
sparc64 （非官方移植版）	732.3 kB	2,039.0 kB	[文件列表]