Paket: r-bioc-pwalign (1.0.0-2)

[ Quellcode: r-bioc-pwalign  ]

Perform pairwise sequence alignments

The two main functions in the package are pairwiseAlignment() and stringDist(). The former solves (Needleman-Wunsch) global alignment, (Smith-Waterman) local alignment, and (ends-free) overlap alignment problems. The latter computes the Levenshtein edit distance or pairwise alignment score matrix for a set of strings.

Andere Pakete mit Bezug zu r-bioc-pwalign

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.4) [mips64el, ppc64, s390x, sparc64]

• dep: libc6.1 (>= 2.1.3) [alpha]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb

• dep: r-api-4.0

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  BioConductor S4 implementation of vectors and lists

• dep: r-bioc-xvector (>= 0.44.0)

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• sug: r-cran-runit

  GNU-R-Paket, das ein Programmiergerüst für Komponententests bereitstellt

r-bioc-pwalign herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
alpha (inoffizielle Portierung)	736,2 kB	1.142,0 kB	[Liste der Dateien]
amd64	737,3 kB	1.103,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	735,8 kB	1.143,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	734,3 kB	1.151,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64 (inoffizielle Portierung)	739,3 kB	1.207,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	737,8 kB	1.143,0 kB	[Liste der Dateien]
riscv64	736,6 kB	1.087,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	737,0 kB	1.107,0 kB	[Liste der Dateien]
sparc64 (inoffizielle Portierung)	732,3 kB	2.039,0 kB	[Liste der Dateien]