Пакет: grabix (0.1.7-5 и други)

[ Източник: grabix  ]

wee tool for random access into BGZF files

In biomedical research it is increasing practice to study the genetic basis of disease. This now frequently comprises the sequencing of human sequences. The output of the machine however is redundant, and the real sequence is the best sequence to explain the redundancy. The exchange of data happens only with compressed files - to huge and redundant to perform otherwise. One should avoid uncompression whenever possible.

grabix leverages the fantastic BGZF library of the samtools package to provide random access into text files that have been compressed with bgzip. grabix creates it's own index (.gbi) of the bgzipped file. Once indexed, one can extract arbitrary lines from the file with the grab command. Or choose random lines with the, well, random command.

Други пакети, свързани с grabix

• dep: libc6 (>= 2.38) [не alpha, ia64, sh4]

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.36) [ia64]

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [не armel, armhf, hppa, m68k]

  GCC support library

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC support library

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC support library

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [не ia64]

  GNU Standard C++ Library v3

  dep: libstdc++6 (>= 5.2) [ia64]

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

• dep: tabix

  generic indexer for TAB-delimited genome position files

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.0)

  compression library - runtime

Изтегляне на grabix

Изтегляне за всички налични архитектури

Архитектура	Версия	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
alpha (неофициална архитектура)	0.1.7-5	14,7 кБ	92,0 кБ	[списък на файловете]
amd64	0.1.7-5	14,9 кБ	56,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	0.1.7-5	14,2 кБ	92,0 кБ	[списък на файловете]
armel	0.1.7-5	15,9 кБ	91,0 кБ	[списък на файловете]
armhf	0.1.7-5	15,2 кБ	91,0 кБ	[списък на файловете]
hppa (неофициална архитектура)	0.1.7-5	16,5 кБ	52,0 кБ	[списък на файловете]
i386	0.1.7-5	16,1 кБ	59,0 кБ	[списък на файловете]
ia64 (неофициална архитектура)	0.1.7-4	16,9 кБ	63,0 кБ	[списък на файловете]
m68k (неофициална архитектура)	0.1.7-5	26,4 кБ	108,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	0.1.7-5	15,4 кБ	93,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64 (неофициална архитектура)	0.1.7-5	15,2 кБ	92,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	0.1.7-5	14,9 кБ	92,0 кБ	[списък на файловете]
riscv64	0.1.7-5	14,3 кБ	48,0 кБ	[списък на файловете]
s390x	0.1.7-5	14,5 кБ	52,0 кБ	[списък на файловете]
sh4 (неофициална архитектура)	0.1.7-5	28,3 кБ	148,0 кБ	[списък на файловете]
sparc64 (неофициална архитектура)	0.1.7-5	14,0 кБ	1 054,0 кБ	[списък на файловете]
x32 (неофициална архитектура)	0.1.7-5	14,9 кБ	51,0 кБ	[списък на файловете]