Пакет: examl (3.0.22-6 и други)

Връзки за examl

Ресурси за Debian:

Изтегляне на пакет-източник examl.

Отговорници:

Външни препратки:

Начална страница [github.com]

Подобни пакети:

Exascale Maximum Likelihood (ExaML) code for phylogenetic inference

Exascale Maximum Likelihood (ExaML) is a code for phylogenetic inference using MPI. This code implements the popular RAxML search algorithm for maximum likelihood based inference of phylogenetic trees.

ExaML is a strapped-down light-weight version of RAxML for phylogenetic inference on huge datasets. It can only execute some very basic functions and is intended for computer-savvy users that can write little perl-scripts and have experience using queue submission scripts for clusters. ExaML only implements the CAT and GAMMA models of rate heterogeneity for binary, DNA, and protein data.

ExaML uses a radically new MPI parallelization approach that yields improved parallel efficiency, in particular on partitioned multi-gene or whole-genome datasets. It also implements a new load balancing algorithm that yields better parallel efficiency.

It is up to 4 times faster than its predecessor RAxML-Light and scales to a larger number of processors.

Други пакети, свързани с examl

зависимости

препоръчани

предложени

enhances

dep: libc6 (>= 2.38) [не alpha, ia64, loong64, sh4]

GNU C Library: Shared libraries
също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.40) [loong64, sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

GNU C Library: Shared libraries
също и виртуален пакет, предлаган от libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]
dep: libmpich12 [armel, armhf, hppa, i386, m68k, sh4]

Shared libraries for MPICH

dep: libmpich12 (>= 4.2.0) [x32]
dep: libopenmpi3t64 (>= 4.1.6) [ia64]

high performance message passing library -- shared library
dep: libopenmpi40 (>= 5.0.6) [loong64, ppc64, sparc64]

high performance message passing library -- shared library

dep: libopenmpi40 (>= 5.0.7) [alpha, amd64, arm64, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x]
dep: mpi-default-bin [не ia64]

Standard MPI runtime programs (metapackage)
dep: openmpi-bin [ia64]

high performance message passing library -- binaries

Изтегляне на examl

Изтегляне за всички налични архитектури
Архитектура	Версия	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
alpha (неофициална архитектура)	3.0.22-6+b2	832,6 кБ	1 921,0 кБ	[списък на файловете]
amd64	3.0.22-6+b3	959,8 кБ	6 371,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	3.0.22-6+b3	778,9 кБ	1 665,0 кБ	[списък на файловете]
armel	3.0.22-6+b2	797,6 кБ	2 046,0 кБ	[списък на файловете]
armhf	3.0.22-6+b2	785,0 кБ	1 598,0 кБ	[списък на файловете]
hppa (неофициална архитектура)	3.0.22-6+b1	813,1 кБ	1 744,0 кБ	[списък на файловете]
i386	3.0.22-6+b2	1 094,5 кБ	7 369,0 кБ	[списък на файловете]
ia64 (неофициална архитектура)	3.0.22-5	955,5 кБ	2 818,0 кБ	[списък на файловете]
loong64 (неофициална архитектура)	3.0.22-6	795,0 кБ	1 791,0 кБ	[списък на файловете]
m68k (неофициална архитектура)	3.0.22-6+b1	763,6 кБ	1 782,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	3.0.22-6+b3	819,7 кБ	1 813,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64 (неофициална архитектура)	3.0.22-6+b2	835,6 кБ	1 921,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	3.0.22-6+b3	836,8 кБ	1 793,0 кБ	[списък на файловете]
riscv64	3.0.22-6+b3	835,0 кБ	1 577,0 кБ	[списък на файловете]
s390x	3.0.22-6+b3	826,1 кБ	2 061,0 кБ	[списък на файловете]
sh4 (неофициална архитектура)	3.0.22-6+b1	888,6 кБ	1 854,0 кБ	[списък на файловете]
sparc64 (неофициална архитектура)	3.0.22-6+b2	816,1 кБ	3 718,0 кБ	[списък на файловете]
x32 (неофициална архитектура)	3.0.22-6+b1	781,9 кБ	1 742,0 кБ	[списък на файловете]