Balík: examl (3.0.22-6 a iné)

Odkazy pre examl

Zdroje Debian:

Stiahnuť zdrojový balík examl:

Správcovia:

Externé zdroje:

Domovská stránka [github.com]

Podobné balíky:

Exascale Maximum Likelihood (ExaML) code for phylogenetic inference

Exascale Maximum Likelihood (ExaML) is a code for phylogenetic inference using MPI. This code implements the popular RAxML search algorithm for maximum likelihood based inference of phylogenetic trees.

ExaML is a strapped-down light-weight version of RAxML for phylogenetic inference on huge datasets. It can only execute some very basic functions and is intended for computer-savvy users that can write little perl-scripts and have experience using queue submission scripts for clusters. ExaML only implements the CAT and GAMMA models of rate heterogeneity for binary, DNA, and protein data.

ExaML uses a radically new MPI parallelization approach that yields improved parallel efficiency, in particular on partitioned multi-gene or whole-genome datasets. It also implements a new load balancing algorithm that yields better parallel efficiency.

It is up to 4 times faster than its predecessor RAxML-Light and scales to a larger number of processors.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom examl

závisí

odporúča

navrhuje

vylepšuje

dep: libc6 (>= 2.38) [nie alpha, ia64, sh4]

knižnica GNU C - zdieľané knižnice
tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

knižnica GNU C - zdieľané knižnice
tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]
dep: libmpich12 [armel, armhf, hppa, i386, m68k, sh4]

Shared libraries for MPICH

dep: libmpich12 (>= 4.2.0) [x32]
dep: libopenmpi3t64 (>= 4.1.6) [ia64]

knižnica na vyskokovýkonné odovzdávanie správ - zdieľaná knižnica
dep: libopenmpi40 (>= 5.0.6) [nie armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, sh4, x32]

knižnica na vyskokovýkonné odovzdávanie správ - zdieľaná knižnica
dep: mpi-default-bin [nie ia64]

štandardné dynamické programy MPI - metabalík
dep: openmpi-bin [ia64]

knižnica na vyskokovýkonné odovzdávanie správ - spustiteľné súbory

Stiahnuť examl

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry
Architektúra	Verzia	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
alpha (neoficiálny port)	3.0.22-6+b1	832.3 kB	1,921.0 kB	[zoznam súborov]
amd64	3.0.22-6+b2	937.8 kB	6,019.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	3.0.22-6+b2	778.7 kB	1,665.0 kB	[zoznam súborov]
armel	3.0.22-6+b1	797.3 kB	2,046.0 kB	[zoznam súborov]
armhf	3.0.22-6+b1	786.3 kB	1,598.0 kB	[zoznam súborov]
hppa (neoficiálny port)	3.0.22-6+b1	813.1 kB	1,744.0 kB	[zoznam súborov]
i386	3.0.22-6+b1	1,078.9 kB	7,013.0 kB	[zoznam súborov]
ia64 (neoficiálny port)	3.0.22-5	955.5 kB	2,818.0 kB	[zoznam súborov]
m68k (neoficiálny port)	3.0.22-6+b1	763.6 kB	1,782.0 kB	[zoznam súborov]
mips64el	3.0.22-6+b2	818.6 kB	1,813.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64 (neoficiálny port)	3.0.22-6+b2	835.6 kB	1,921.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64el	3.0.22-6+b2	837.7 kB	1,793.0 kB	[zoznam súborov]
riscv64	3.0.22-6+b2	835.6 kB	1,577.0 kB	[zoznam súborov]
s390x	3.0.22-6+b2	826.1 kB	2,061.0 kB	[zoznam súborov]
sh4 (neoficiálny port)	3.0.22-6+b1	888.6 kB	1,854.0 kB	[zoznam súborov]
sparc64 (neoficiálny port)	3.0.22-6+b2	816.1 kB	3,718.0 kB	[zoznam súborov]
x32 (neoficiálny port)	3.0.22-6+b1	781.9 kB	1,742.0 kB	[zoznam súborov]