套件：megadepth（1.2.0-4 以及其他的）

[ 原始碼： megadepth  ]

computes coverage from BigWig and BAM sequencing files

A major concern for the interpretation of DNA and RNA (!) sequencing is the number of reads that cover a particular area. This package has interesting statistics for the distinction of coding and non-coding parts of the genome and knows how to interpret transcripts that span multiple exons.

This package is a successor of the program 'bamcount'.

其他與 megadepth 有關的套件

• dep: libbigwig0t64 (>= 0.4.6)

  C library for handling bigWig files

• dep: libc6 (>= 2.34) [除 alpha, arm64, ia64, loong64, sh4]

  GNU C 函式庫：共用函式庫
  同時作為一個虛擬套件由這些套件填實： libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [loong64, sh4]

  dep: libc6 (>= 2.38) [arm64]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU C 函式庫：共用函式庫
  同時作為一個虛擬套件由這些套件填實： libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libcurl3t64-gnutls (>= 7.16.2) [sparc64]

  easy-to-use client-side URL transfer library (GnuTLS flavour)

• dep: libdeflate0 (>= 1.0) [sparc64]

  fast, whole-buffer DEFLATE-based compression and decompression

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, loong64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  GCC 支援函式庫

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, ia64, sh4]

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC 支援函式庫

• dep: libhts3t64 (>= 1.17)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  GNU Standard C++ Library v3

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [sparc64]

  壓縮函式庫 - 跑程式時用(runtime)

• sug: r-bioc-megadepth

  BioCOnductor BigWig and BAM related utilities

下載 megadepth

下載可用於所有硬體架構的

硬體架構	版本	套件大小	安裝後大小	檔案
alpha （非官方移植版）	1.2.0-4+b1	78。4 kB	276。0 kB	[檔案列表]
amd64	1.2.0-4+b1	81。0 kB	275。0 kB	[檔案列表]
arm64	1.2.0-4+b2	72。4 kB	275。0 kB	[檔案列表]
armel	1.2.0-4+b1	70。9 kB	234。0 kB	[檔案列表]
armhf	1.2.0-4+b1	72。5 kB	178。0 kB	[檔案列表]
hppa （非官方移植版）	1.2.0-4+b1	80。2 kB	252。0 kB	[檔案列表]
i386	1.2.0-4+b1	84。1 kB	274。0 kB	[檔案列表]
ia64 （非官方移植版）	1.2.0-4+b1	99。7 kB	467。0 kB	[檔案列表]
loong64 （非官方移植版）	1.2.0-4+b1	74。2 kB	260。0 kB	[檔案列表]
mips64el	1.2.0-4+b1	71。9 kB	282。0 kB	[檔案列表]
ppc64 （非官方移植版）	1.2.0-4+b1	81。5 kB	339。0 kB	[檔案列表]
ppc64el	1.2.0-4+b1	83。3 kB	339。0 kB	[檔案列表]
riscv64	1.2.0-4+b2	79。8 kB	219。0 kB	[檔案列表]
s390x	1.2.0-4+b1	82。1 kB	271。0 kB	[檔案列表]
sh4 （非官方移植版）	1.2.0-4+b1	91。8 kB	275。0 kB	[檔案列表]
sparc64 （非官方移植版）	1.2.0-4+b1	70。2 kB	1，047。0 kB	[檔案列表]
x32 （非官方移植版）	1.2.0-4+b1	83。8 kB	258。0 kB	[檔案列表]