Пакунок: python3-unifrac (1.3-4 and others)

[ Source: unifrac  ]

high-performance phylogenetic diversity calculations

The de facto repository for high-performance phylogenetic diversity calculations. The methods in this repository are based on an implementation of the Strided State UniFrac algorithm which is faster, and uses less memory than Fast UniFrac. Strided State UniFrac supports Unweighted UniFrac, Weighted UniFrac, Generalized UniFrac, Variance Adjusted UniFrac and meta UniFrac. This repository also includes Stacked Faith (manuscript in preparation), a method for calculating Faith's PD that is faster and uses less memory than the Fast UniFrac-based reference implementation.

This package contains the Python3 module.

Інші пакунки пов'язані з python3-unifrac

• dep: cython3 [alpha, m68k]

  C-Extensions for Python 3

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.4) [m68k, mips64el]

• dep: libc6.1 (>= 2.4) [alpha]

  Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
  also a virtual package provided by libc6.1-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [alpha]

  Допоміжна бібліотека GCC

• dep: libssu0 (>= 0.10.0) [alpha]

  high-performance phylogenetic diversity calculations (lib)

  dep: libssu0 (>= 1.1.1) [m68k]

  dep: libssu0 (>= 1.4) [not alpha, m68k]

• dep: libstdc++6 (>= 11) [alpha]

  Стандартна бібліотека C++ GNU, версії 3

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

  dep: python3 (<< 3.11) [alpha]

  dep: python3 (<< 3.12) [m68k]

  dep: python3 (<< 3.14) [not alpha, m68k]

  dep: python3 (>= 3.10~) [alpha, m68k]

  dep: python3 (>= 3.13~) [not alpha, m68k]

• dep: python3-biom-format

  Biological Observation Matrix (BIOM) format (Python 3)

• dep: python3-h5py (>= 3.3.0) [not alpha, m68k]

  general-purpose Python interface to hdf5

• dep: python3-h5py-serial [alpha, m68k]

  general-purpose Python interface to hdf5 (Python 3 serial)

• dep: python3-iow [not alpha]

  balanced parentheses tree structure

• dep: python3-numpy

  Python library for numerical computations (Python 3)

• dep: python3-numpy2-abi0 [not alpha, m68k]

  virtual package provided by python3-numpy

  or python3-numpy-abi9

  virtual package provided by python3-numpy

• dep: python3-skbio [alpha, m68k]

  Python3 data structures, algorithms, educational resources for bioinformatic

  dep: python3-skbio (>= 0.6.1) [not alpha, m68k]

Завантажити python3-unifrac

Завантаження для всіх доступних архітектур

Архітектура	Версія	Розмір пакунка	Розмір після встановлення	Файли
alpha (unofficial port)	0.10.0-3	106.4 kB	582.0 kB	[список файлів]
amd64	1.3-4+b4	147.4 kB	722.0 kB	[список файлів]
arm64	1.3-4+b3	132.6 kB	685.0 kB	[список файлів]
m68k (unofficial port)	1.1.1-2	135.9 kB	715.0 kB	[список файлів]
mips64el	1.3-4+b3	128.8 kB	758.0 kB	[список файлів]
ppc64el	1.3-4+b3	144.7 kB	813.0 kB	[список файлів]
riscv64	1.3-4+b3	145.4 kB	649.0 kB	[список файлів]