パッケージ: python3-unifrac (1.3-4 など)

[ ソース: unifrac  ]

high-performance phylogenetic diversity calculations

The de facto repository for high-performance phylogenetic diversity calculations. The methods in this repository are based on an implementation of the Strided State UniFrac algorithm which is faster, and uses less memory than Fast UniFrac. Strided State UniFrac supports Unweighted UniFrac, Weighted UniFrac, Generalized UniFrac, Variance Adjusted UniFrac and meta UniFrac. This repository also includes Stacked Faith (manuscript in preparation), a method for calculating Faith's PD that is faster and uses less memory than the Fast UniFrac-based reference implementation.

This package contains the Python3 module.

その他の python3-unifrac 関連パッケージ

• dep: cython3 [alpha, m68k]

  C-Extensions for Python 3

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.4) [m68k, mips64el]

• dep: libc6.1 (>= 2.4) [alpha]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6.1-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [alpha]

  GCC 共有ライブラリ

• dep: libssu0 (>= 0.10.0) [alpha]

  high-performance phylogenetic diversity calculations (lib)

  dep: libssu0 (>= 1.1.1) [m68k]

  dep: libssu0 (>= 1.4) [alpha, m68k 以外]

• dep: libstdc++6 (>= 11) [alpha]

  GNU 標準 C++ ライブラリ v3

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

  dep: python3 (<< 3.11) [alpha]

  dep: python3 (<< 3.12) [m68k]

  dep: python3 (<< 3.14) [alpha, m68k 以外]

  dep: python3 (>= 3.10~) [alpha, m68k]

  dep: python3 (>= 3.13~) [alpha, m68k 以外]

• dep: python3-biom-format

  Biological Observation Matrix (BIOM) format (Python 3)

• dep: python3-h5py (>= 3.3.0) [alpha, m68k 以外]

  general-purpose Python interface to hdf5

• dep: python3-h5py-serial [alpha, m68k]

  general-purpose Python interface to hdf5 (Python 3 serial)

• dep: python3-iow [alpha 以外]

  balanced parentheses tree structure

• dep: python3-numpy

  Python library for numerical computations (Python 3)

• dep: python3-numpy2-abi0 [alpha, m68k 以外]

  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: python3-numpy

  または python3-numpy-abi9

  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: python3-numpy

• dep: python3-skbio [alpha, m68k]

  Python3 data structures, algorithms, educational resources for bioinformatic

  dep: python3-skbio (>= 0.6.1) [alpha, m68k 以外]

python3-unifrac のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	バージョン	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
alpha (非公式の移植版)	0.10.0-3	106.4 kB	582.0 kB	[ファイル一覧]
amd64	1.3-4+b4	147.4 kB	722.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	1.3-4+b3	132.6 kB	685.0 kB	[ファイル一覧]
m68k (非公式の移植版)	1.1.1-2	135.9 kB	715.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	1.3-4+b3	128.8 kB	758.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	1.3-4+b3	144.7 kB	813.0 kB	[ファイル一覧]
riscv64	1.3-4+b3	145.4 kB	649.0 kB	[ファイル一覧]