Пакунок: megadepth (1.2.0-4 and others) [debports]

[ Source:  ]

computes coverage from BigWig and BAM sequencing files

A major concern for the interpretation of DNA and RNA (!) sequencing is the number of reads that cover a particular area. This package has interesting statistics for the distinction of coding and non-coding parts of the genome and knows how to interpret transcripts that span multiple exons.

This package is a successor of the program 'bamcount'.

Інші пакунки пов'язані з megadepth

• dep: libbigwig0t64 (>= 0.4.6)

  C library for handling bigWig files

• dep: libc6.1 (>= 2.37)

  Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
  also a virtual package provided by libc6.1-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 4.2)

  Допоміжна бібліотека GCC

• dep: libhts3t64 (>= 1.17)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  Стандартна бібліотека C++ GNU, версії 3

• dep: libunwind8

  library to determine the call-chain of a program - runtime

• sug: r-bioc-megadepth

  BioCOnductor BigWig and BAM related utilities

Завантажити megadepth

Завантаження для всіх доступних архітектур

Архітектура	Версія	Розмір пакунка	Розмір після встановлення	Файли
ia64 (unofficial port)	1.2.0-4+b1	99.7 kB	467.0 kB	[список файлів]