Paket: dnaclust (3-7 ve diğerleri)

[ Kaynak: dnaclust  ]

tool for clustering millions of short DNA sequences

dnaclust is a tool for clustering large number of short DNA sequences. The clusters are created in such a way that the "radius" of each clusters is no more than the specified threshold.

The input sequences to be clustered should be in Fasta format. The id of each sequence is based on the first word of the seqeunce in the Fasta format. The first word is the prefix of the header up to the first occurrence of white space characters in the header.

Etiketler: Biyoloji: Fasta/Pearson, Nükleik Asitler, Alan: field::biology, field::biology:bioinformatics, Geliştirildiği dil: C++, Rol: role::program, works-with::biological-sequence

dnaclust ile İlgili Diğer Paketler

• dep: libboost-program-options1.74.0 (>= 1.74.0) [riscv64]

  program options library for C++

• dep: libboost-program-options1.83.0 (>= 1.83.0) [riscv64 değil]

  program options library for C++

• dep: libc6 (>= 2.34) [alpha, ia64, loong64, sh4 değil]

  GNU C Library: Shared libraries
  ayrıca şunun tarafından sağlanan bir sanal paket libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [loong64, sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU C Library: Shared libraries
  ayrıca şunun tarafından sağlanan bir sanal paket libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, loong64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  GCC support library

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC support library

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC support library

• dep: libstdc++6 (>= 11) [riscv64]

  GNU Standard C++ Library v3

  dep: libstdc++6 (>= 13.1) [arm64, riscv64, x32 değil]

  dep: libstdc++6 (>= 14) [arm64, x32]

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

dnaclust indir

Tüm mevcut mimariler için indir

Mimari	Sürüm	Paket Boyutu	Kurulu Boyut	Dosyalar
alpha (resmi olmayan port)	3-7+b4	109,6 kB	735,0 kB	[dosya listesi]
amd64	3-7+b3	111,9 kB	681,0 kB	[dosya listesi]
arm64	3-7+b5	104,7 kB	733,0 kB	[dosya listesi]
armel	3-7+b3	101,5 kB	646,0 kB	[dosya listesi]
armhf	3-7+b3	101,2 kB	582,0 kB	[dosya listesi]
hppa (resmi olmayan port)	3-7+b3	107,5 kB	672,0 kB	[dosya listesi]
i386	3-7+b3	115,6 kB	678,0 kB	[dosya listesi]
ia64 (resmi olmayan port)	3-7+b3	124,5 kB	904,0 kB	[dosya listesi]
loong64 (resmi olmayan port)	3-7+b1	105,4 kB	687,0 kB	[dosya listesi]
m68k (resmi olmayan port)	3-7+b3	109,9 kB	666,0 kB	[dosya listesi]
mips64el	3-7+b3	112,2 kB	880,0 kB	[dosya listesi]
ppc64 (resmi olmayan port)	3-7+b3	115,9 kB	861,0 kB	[dosya listesi]
ppc64el	3-7+b3	114,6 kB	861,0 kB	[dosya listesi]
riscv64 (resmi olmayan port)	3-7+b3	103,9 kB	623,0 kB	[dosya listesi]
s390x	3-7+b3	115,3 kB	701,0 kB	[dosya listesi]
sh4 (resmi olmayan port)	3-7+b3	117,5 kB	732,0 kB	[dosya listesi]
sparc64 (resmi olmayan port)	3-7+b3	99,6 kB	3.494,0 kB	[dosya listesi]
x32 (resmi olmayan port)	3-7+b4	111,5 kB	650,0 kB	[dosya listesi]