Pacote: dnaclust (3-7 e outros)

[ Fonte: dnaclust  ]

tool for clustering millions of short DNA sequences

dnaclust is a tool for clustering large number of short DNA sequences. The clusters are created in such a way that the "radius" of each clusters is no more than the specified threshold.

The input sequences to be clustered should be in Fasta format. The id of each sequence is based on the first word of the seqeunce in the Fasta format. The first word is the prefix of the header up to the first occurrence of white space characters in the header.

Etiquetas: Biologia: Fasta/Pearson, Ácidos nucleicos, Campo: field::biology, field::biology:bioinformatics, Implementado em: C++, Função: role::program, works-with::biological-sequence

Outros pacotes relacionados a dnaclust

• dep: libboost-program-options1.74.0 (>= 1.74.0) [riscv64]

  program options library for C++

• dep: libboost-program-options1.83.0 (>= 1.83.0) [não riscv64]

  program options library for C++

• dep: libc6 (>= 2.34) [não alpha, ia64, loong64, sh4]

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [loong64, sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, loong64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  Biblioteca de suporte GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  Biblioteca de suporte GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  Biblioteca de suporte GCC

• dep: libstdc++6 (>= 11) [riscv64]

  Biblioteca C++ padrão da GNU v3

  dep: libstdc++6 (>= 13.1) [não arm64, riscv64, x32]

  dep: libstdc++6 (>= 14) [arm64, x32]

• dep: libunwind8 [ia64]

  biblioteca para determinar a cadeia de chamadas de um programa - execução

Download de dnaclust

Baixe para todas as arquiteturas disponíveis

Arquitetura	Versão	Tamanho do pacote	Tamanho instalado	Arquivos
alpha (porte não oficial)	3-7+b4	109.6 kB	735.0 kB	[lista de arquivos]
amd64	3-7+b3	111.9 kB	681.0 kB	[lista de arquivos]
arm64	3-7+b5	104.7 kB	733.0 kB	[lista de arquivos]
armel	3-7+b3	101.5 kB	646.0 kB	[lista de arquivos]
armhf	3-7+b3	101.2 kB	582.0 kB	[lista de arquivos]
hppa (porte não oficial)	3-7+b3	107.5 kB	672.0 kB	[lista de arquivos]
i386	3-7+b3	115.6 kB	678.0 kB	[lista de arquivos]
ia64 (porte não oficial)	3-7+b3	124.5 kB	904.0 kB	[lista de arquivos]
loong64 (porte não oficial)	3-7+b1	105.4 kB	687.0 kB	[lista de arquivos]
m68k (porte não oficial)	3-7+b3	109.9 kB	666.0 kB	[lista de arquivos]
mips64el	3-7+b3	112.2 kB	880.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64 (porte não oficial)	3-7+b3	115.9 kB	861.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64el	3-7+b3	114.6 kB	861.0 kB	[lista de arquivos]
riscv64 (porte não oficial)	3-7+b3	103.9 kB	623.0 kB	[lista de arquivos]
s390x	3-7+b3	115.3 kB	701.0 kB	[lista de arquivos]
sh4 (porte não oficial)	3-7+b3	117.5 kB	732.0 kB	[lista de arquivos]
sparc64 (porte não oficial)	3-7+b3	99.6 kB	3,494.0 kB	[lista de arquivos]
x32 (porte não oficial)	3-7+b4	111.5 kB	650.0 kB	[lista de arquivos]