Package: dnaclust (3-7 and others)

[ Source: dnaclust  ]

strumento per raggruppare in cluster milioni di corte sequenze di DNA

dnaclust è uno strumento per raggruppare in cluster un vasto numero di corte sequenze di DNA. I cluster vengono creati in un modo tale che il "raggio" di ogni cluster è più piccolo di una soglia specificata.

Le sequenze di input da raggruppare in cluster devono essere in formato Fasta. L'ID di ogni sequenza è basato sulla prima parola della sequenza nel formato Fasta. La prima parola è il prefisso dell'intestazione fino alla prima occorrenza di caratteri vuoti di spazio nell'intestazione.

Tags: Biology: Fasta/Pearson, Nucleic Acids, Field: field::biology, field::biology:bioinformatics, Implemented in: C++, Role: role::program, works-with::biological-sequence

Other Packages Related to dnaclust

• dep: libboost-program-options1.74.0 (>= 1.74.0) [riscv64]

  libreria per opzioni di programma per C++

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  libreria per opzioni di programma per C++

• dep: libc6 (>= 2.34) [not alpha, ia64, loong64, sh4]

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [loong64, sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, loong64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  libreria di supporto a GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  libreria di supporto a GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  libreria di supporto a GCC

• dep: libstdc++6 (>= 11) [riscv64]

  libreria GNU Standard C++, versione 3

  dep: libstdc++6 (>= 13.1) [not arm64, riscv64, x32]

  dep: libstdc++6 (>= 14) [arm64, x32]

• dep: libunwind8 [ia64]

  libreria per tracciare la catena di chiamate di un programma - runtime

Download dnaclust

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
alpha (unofficial port)	3-7+b4	109.6 kB	735.0 kB	[list of files]
amd64	3-7+b3	111.9 kB	681.0 kB	[list of files]
arm64	3-7+b5	104.7 kB	733.0 kB	[list of files]
armel	3-7+b3	101.5 kB	646.0 kB	[list of files]
armhf	3-7+b3	101.2 kB	582.0 kB	[list of files]
hppa (unofficial port)	3-7+b3	107.5 kB	672.0 kB	[list of files]
i386	3-7+b3	115.6 kB	678.0 kB	[list of files]
ia64 (unofficial port)	3-7+b3	124.5 kB	904.0 kB	[list of files]
loong64 (unofficial port)	3-7+b1	105.4 kB	687.0 kB	[list of files]
m68k (unofficial port)	3-7+b3	109.9 kB	666.0 kB	[list of files]
mips64el	3-7+b3	112.2 kB	880.0 kB	[list of files]
ppc64 (unofficial port)	3-7+b3	115.9 kB	861.0 kB	[list of files]
ppc64el	3-7+b3	114.6 kB	861.0 kB	[list of files]
riscv64 (unofficial port)	3-7+b3	103.9 kB	623.0 kB	[list of files]
s390x	3-7+b3	115.3 kB	701.0 kB	[list of files]
sh4 (unofficial port)	3-7+b3	117.5 kB	732.0 kB	[list of files]
sparc64 (unofficial port)	3-7+b3	99.6 kB	3,494.0 kB	[list of files]
x32 (unofficial port)	3-7+b4	111.5 kB	650.0 kB	[list of files]