Paket: dascrubber (1.1-4 ve diğerleri)

[ Kaynak: dascrubber  ]

alignment-based scrubbing pipeline for DNA sequencing reads

The Dazzler Scrubbing Suite produces a set of edited reads that are guaranteed to

 * be continuous stretches of the underlying genome (i.e. no unremoved
   adapters and not chimers)
 * have no very low quality stretches (i.e. the error rate never exceeds some
   reasonable maximum, 20% or so in the case of Pacbio data).

Its secondary goal is to do so with the minimum removal of data and splitting of reads.

dascrubber ile İlgili Diğer Paketler

• dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

  GNU C Library: Shared libraries
  ayrıca şunun tarafından sağlanan bir sanal paket libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.31) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.34) [arm64, riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.36) [loong64]

  dep: libc6 (>= 2.7) [alpha, arm64, ia64, loong64, ppc64el, riscv64, sh4, x32 değil]

• dep: libc6.1 (>= 2.31) [ia64]

  GNU C Library: Shared libraries
  ayrıca şunun tarafından sağlanan bir sanal paket libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.7) [alpha]

• sug: daligner

  local alignment discovery between long nucleotide sequencing reads

• sug: dazzdb

  manage nucleotide sequencing read data

dascrubber indir

Tüm mevcut mimariler için indir

Mimari	Sürüm	Paket Boyutu	Kurulu Boyut	Dosyalar
alpha (resmi olmayan port)	1.1-4	159,8 kB	1.381,0 kB	[dosya listesi]
amd64	1.1-4	163,9 kB	1.185,0 kB	[dosya listesi]
arm64	1.1-4+b1	155,0 kB	1.534,0 kB	[dosya listesi]
armel	1.1-4	139,8 kB	1.139,0 kB	[dosya listesi]
armhf	1.1-4	137,6 kB	803,0 kB	[dosya listesi]
hppa (resmi olmayan port)	1.1-4	150,4 kB	1.169,0 kB	[dosya listesi]
i386	1.1-4	157,6 kB	1.327,0 kB	[dosya listesi]
ia64 (resmi olmayan port)	1.1-4	185,4 kB	2.282,0 kB	[dosya listesi]
loong64 (resmi olmayan port)	1.1-4	144,8 kB	1.133,0 kB	[dosya listesi]
m68k (resmi olmayan port)	1.1-4	141,1 kB	1.139,0 kB	[dosya listesi]
mips64el	1.1-4	135,7 kB	1.217,0 kB	[dosya listesi]
ppc64 (resmi olmayan port)	1.1-4	154,2 kB	1.725,0 kB	[dosya listesi]
ppc64el	1.1-4	165,7 kB	1.789,0 kB	[dosya listesi]
riscv64	1.1-4+b1	166,3 kB	930,0 kB	[dosya listesi]
s390x	1.1-4	155,1 kB	1.237,0 kB	[dosya listesi]
sh4 (resmi olmayan port)	1.1-4	159,6 kB	999,0 kB	[dosya listesi]
sparc64 (resmi olmayan port)	1.1-4	130,1 kB	1.159,0 kB	[dosya listesi]
x32 (resmi olmayan port)	1.1-4	158,9 kB	1.151,0 kB	[dosya listesi]